在很長的潛伏期中，感染者雖然沒有自覺癥狀，外表一如常人，但全身免疫系統仍在繼續受到艾滋病病毒的破壞，到免疫系統功能再也不能維持最低的防御能力時，多種對正常人不會引起疾病的病原微生物便會使患者發生條件性感染，引起腦、肺、胃腸道和其他部位的病變及癥狀。

常見的癥狀有以下幾個方面：

(1)一般性癥狀持續發燒、虛弱、盜汗、全身淺表淋巴結腫大，體重下降在三個月之內可達10%以上，最多可降低40%，病人消瘦特別明顯。

(2)呼吸道癥狀長期咳嗽、胸痛、呼吸困難、嚴重時痰中帶血。

(3)消化道癥狀食欲下降、厭食、惡心、嘔吐、腹瀉、嚴重時可便血。通常用于治療消化道感染的藥物對這種腹瀉無效。

(4)神經系統癥狀頭暈、頭痛、反應遲鈍、智力減退、精神異常、抽風、偏癱、癡呆等。

(5)皮膚和粘膜損害彌漫性丘疹、帶狀皰疹、口腔和咽部粘膜炎癥及潰爛。

(6)腫瘤可出現多種惡性腫瘤，位于體表的卡波希氏肉瘤可見紅色或紫紅色的斑疹、丘疹和浸潤性腫塊。所以，艾滋病的癥狀是非常復雜的。

許多受艾滋病病毒感染的人在潛伏期沒有任何自覺癥狀，但也有一部分人在感染早期可以出現發燒、頭暈、無力、咽痛、關節疼痛、皮疹、全身淺表淋巴結腫大等類似“感冒”的癥狀，有些人還可發生腹瀉。