1.急性菌痢：應用抗生素和其他輔助藥為主。

2.急性中毒型菌痢：抗生素聯用，積極治療高熱、驚厥、回圈衰竭和呼吸衰竭。

3.慢性菌痢：抗菌藥聯用、加強支持治療和合并癥治療的綜合治療。

4.高熱和驚厥的治療：選用安定、苯巴比妥納、復方冬眠靈等。

5.休克治療：選用654-2或阿托品、低分子右旋糖酐、5%碳酸氫納、多巴胺與阿拉明、西地蘭、地塞米松等。

6.呼吸衰竭治療：選用20%甘露醇、地塞米松、可拉明或洛貝林等。

7.DIC治療：選用肝素治療。

8.中藥治療：黃連、生大蒜、白頭翁湯。