病變從上呼吸道開始，有充血、單核細胞浸潤，向支氣管和肺蔓延，呈間質性肺炎或斑片融合性支氣管肺炎。一般起病緩漸，有乏力、咽痛、咳嗽、發熱、納差、肌痛等。半數病例無癥狀。X線顯示肺部多種形態的浸潤影，呈節段性分布，以肺下野為多見，有的從肺門附近向外伸展。支氣體肺炎可在3－4周自行消散。兒童可并發鼓膜炎和中耳炎，伴有血液（急性溶血、血小板減少性紫癜）或神經（周圍性神經炎、胸膜炎等）等并發癥或雷諾現象（受冷時四肢間歇蒼白或紫紺并感疼痛）時，則病程延長。

起病緩慢，潛伏期約2—3周，病初有全身不適，乏力、頭痛。2—3天后出現發熱體溫常達39℃左右，可持續1—3周，可伴有咽痛和肌肉酸痛。

咳嗽為本病突出的癥狀，一般于病后2—3天開始，初為干咳，后轉為頑固性劇咳、常有粘稠痰液偶帶血絲，少數病例可類似百日咳樣陣咳。可持續1—4周。肺部體征多不明顯，甚至全無。少數可聽到干、濕羅音樂。但多塊消失，故體征與劇咳及發熱等臨床表現不一致，為本病特點之一。嬰幼兒起病急，病程長，病情較重，表現為呼吸困難、喘憋、喘鳴音較為突出，肺部羅音比年長兒多。部分患兒童可患有溶血性貧血，腦膜炎、心肌炎、呻吟、格林—把利綜合征等肺外表現。

周圍血白細胞總數正常或稍增多，以中性粒細胞為主。起病后2周，約2／3病人冷凝集試驗陽性，滴定效價大于1：32，特別是當滴度逐步升高時，有診斷價值。約半數病人對鏈球菌MG凝集試驗陽性。診斷的進一步證實有賴于血清中支原體IgM抗體的測定（酶聯免疫吸附試驗最敏感，免疫熒光法特異性強，間接血凝法較實用）。抗原檢測可用PCR法，但試劑藥盒還有待改進，以提高敏感性和特異性。