小兒腎病綜合征主要是應用具有補脾益腎、消腫利尿的中藥藥物進行治療。
常用的中草藥包括車前子、白芍、附子、白術、茯苓、澤瀉、黃芪以及薏苡仁等。比較常用的中成藥包括六味地黃丸或者腎氣丸等。應用上述藥物幫助腎病綜合征患兒改善低蛋白血癥、高蛋白尿以及水腫等不適癥狀。但用藥應謹遵醫囑，不能擅自用藥，以免引起身體不適。
可服用糖皮質激素類藥物：可以降低基底膜通透性，改善水腫，癥狀改善后逐漸減量。循經護腎療法：通過健脾益腎、利水排毒來達到增加腎臟血流灌注，促進新陳代謝，改變腎臟病理結構。
腎病綜合癥轉激素治療是起始要足量，減藥要緩慢，而且要長期維持。腎病綜合征這種疾病是和免疫相關的一種疾病，治療這種疾病主要是應用激素，激素能夠抑制身體內過強的免疫反應，從而達到保護腎臟的目的。
兒童先天性腎病綜合癥（先天性腎病綜合癥）相對預后較差，但極少有腎功能衰竭發生，大多數病例狐仙感染較重，營養不良，腹瀉和水電解質紊亂等癥狀較多，其治療方法以對癥支持治療為主。
需緩解水腫、限制食鹽、利尿劑如速尿等。需給以高熱量充足蛋白質，同樣在感染發生時需控制感染，可選用頭孢或阿莫西林等。用血管緊張素轉化酶抑制劑（如卡托普利）能顯著緩解蛋白尿。
中藥多途徑療法治療：這種炮制中藥多途徑療能通過擴張血管、抗炎、抗凝、降解、修復等措施后，使受損的腎臟固有細胞恢復原來的功能。一般治療：給予正常量的優質蛋白飲食。