應該去醫院做腦血流圖進行檢查，主要是看腦部血管有沒有痙攣或者狹窄的情況出現，那樣就會影響腦部的血液循環，就會出現這樣的癥狀。這情況臨床都會采用活血化瘀，擴張血管，促進血液循環的方法進行治療。

腦炎后遺癥頭疼可以針對性的應用一些止痛的藥物進行治療。
腦炎可能會出現一些后遺癥，比如對藥物反應性不好，或者沒有進行積極的藥物治療，尤其是如果感染的癥狀非常重，顱內的病灶比較廣泛，又是累積了一些關鍵部位的病變，比如腦干的病變。如果不是因為顱內壓增高或者排除了一些腦出血，只是單純的功能性頭疼的話，可以用一些去痛的藥物。
建議：給予營養神經、脫水，預防癲癇治療。