兒童不典型川崎病一般不會自愈。
兒童不典型川崎病一般在臨床上可能沒有明顯癥狀，此時一般不易被發現，可能會導致病情延誤，而病情延誤可能會導致病情進一步加重，使患兒錯過最佳治療時機，可能會出現多種并發癥。所以兒童不典型川崎病一般不會自愈，需要及時進行治療，一般可以在醫生的指導下及時確診，進行積極治療，有效控制病情，避免引起冠狀動脈的病變，降低并發癥的發病率。
川崎病患者大多有較好的預后，部分患者能自行康復。不典型的川崎病，最大的危險在于它會導致冠狀動脈的擴張，如果不是這樣的話，它是可以自行愈合的。不典型的川崎病也可以通過適當的治療來恢復。
但也有少數兒童，出現冠狀動脈瘤的幾率在15-30%之間。要是冠狀動脈瘤出現了破裂、血栓、心肌炎之類的情況，那可是要人命的。甚至在康復期間，還會因為缺血性心臟病而突然死亡。如果能夠及時發現非典型川崎病，可以在急性期給予阿司匹林或丙種球蛋白等藥物，預后較好。
有一定的自愈概率，川崎病大多數患兒預后都是良好的，呈自限性，經過有一定的自愈幾率，一般經過適當的治療，就可以初見康復，但是15%至30%的川崎病患，可發生冠狀動脈瘤，由于冠狀動脈瘤破裂，血栓的閉塞或者心肌炎而死亡，甚至在恢復期中可以出現缺血性心臟病猝死。
川崎病有多器官系統的表現，癥狀有不明原因的發熱持續5天或者更久，雙側結膜充血、眼球發紅是一個典型表現�？谇患把什空衬浡猿溲l紅、唇發紅或者干裂、舌面紅腫，發病初期手、腳硬腫，手心和腳心發紅，疾病期，手腳尖端都有脫皮。
不典型川崎病可以治療，川崎病是一種以全身無菌性血管炎病變為主要病理特點的小兒疾病，好發于5歲以下小孩，一般表現為急性發熱，發熱超過5天，身上有一過性的皮疹，頸部淋巴結腫大，舌頭可以出現楊梅舌，也就是舌頭上面舌乳頭是隆起的，看起來就像一個新鮮的楊梅，到后期的時候還會有口唇干燥、皸裂等一系列的表現。
這種疾病的治療費用十分昂貴，因為現在還不能一次性完全治療痊愈，只能先使用藥物進行緩解性的治療，而緩解性治療的藥物價格也十分昂貴，多在六千元到一萬元左右，需要進行多療程的治療，總體花費可能在十萬元到二十萬元左右。