一般來說，早孕孕酮低應該根據實際情況來處理。
孕酮是一種類固醇激素，主要在卵巢黃體的細胞以及妊娠胎盤中產生孕激素。早孕孕酮低應該檢查彩超，確診是宮內孕和宮外孕，并遵醫囑服用黃體酮進行保胎治療
患者平時應該注意營養均衡，清淡飲食；早睡早起，避免熬夜以及過度勞累；應該適當運動，比如慢跑、游泳等，提高免疫力。
懷孕12周了孕酮低，陰道沒有出血等異常癥狀，不需要特殊處理，這時候胎盤已經形成，孕激素開始由胎盤分泌代替妊娠黃體分泌，受精卵著床相對來說比較牢靠，不會因孕酮低導致流產的發生，出現陰道出血或者身體異常的狀況就需要去醫院進行檢查治療，放松心情，定期檢查。
早孕孕酮太低應注意休息，可以在醫生的指導下使用藥物進行調理。
如果在懷孕初期孕酮過低，通常與女性的身體的血液和卵子的生長有一定的聯系，這是因為孕婦的孕激素水平過低導致的。如果孕酮過低，可能會導致先兆流產。平時要多休息，少吃一些辛辣刺激的東西。平時要注意保持外陰的干凈，室內要多通風，可以服用黃體酮膠囊等改善癥狀。平時要注意少吃多餐注意營養，提高身體素質。
早期孕酮較低時，可導致先兆流產征象，如無其它特別不舒服的征象，應注意休息、忌疲勞、勿久站、勿多走等。
孕前3個月對胎兒發育至關重要，可補充葉酸日預防胎兒神經管畸形、強化營養、增強體質、不隨便用某些活血化瘀藥。可根據個人體質，酌情選擇是否需服用某些保胎藥。患者需要注意的是，在平時應當注意保持充足的休息，避免過度勞累。
發現早孕后，有計劃妊娠的可以做血HCG和孕酮檢測，并通過動態觀察監測妊囊的發育狀態。在停經5-6周的時候做超聲檢查排除宮外孕。如果選擇人工流產應在懷孕49天左右進行。