藥物流產流干凈的概率大約在90%以上。
妊娠早期不超過49天可以在門診應用藥物流產，超過49天要慎重考慮，如果有必要的話要住院治療。藥物流產有一定的禁忌癥，高血壓、心臟病、青光眼等都不能使用藥物流產，因為流產藥物主要是激素類藥物，會導致病情惡化。另外，藥物流產后要選擇正規的醫院進行治療，因為藥物流產最大的副作用就是流血過多。

自然流產流干凈的概率是百分之七十左右。如果發生了不可避免的自然流產，絕大多數都能夠流干凈。極個別的流不干凈，宮頸口或者大部分組織流干凈了，小部分組織粘留在宮腔內，流不干凈做彩超能夠發現。

自然流產分為完全流產和不全流產。是否能夠流干凈，根據孕周的大小以及是否在孕期吃過保胎藥來決定。如果孕期服用過保胎藥物或者孕周比較大，流出來的幾率和流干凈的幾率就會減少。如果孕周比較小，孕期也沒吃過保胎藥，發生殘留的機會就會比較小。在自然流產發生后還是要服用一些促進子宮收縮和活血化瘀的藥物。

藥物流產需要10-14天左右流干凈。
女性在懷孕后可以通過藥物流產或是人工流產將孕囊排出，如果選擇藥物流產的話，一般在服藥后的第三天就能排出，排出時間在2-3個小時，且在10-14天才能完全流干凈。如果在14天后仍然出現出血的情況，需要及時前往醫院進行檢查，如果宮腔內仍有殘留物，需要進行清宮手術將殘留物排出，避免出現感染。

自然流產通常陰道出血的時間不超過一周，如果在自然流產后一周沒有陰道出血的癥狀。流產后隨著子宮內膜的修復，子宮的收縮，如果出血逐漸停止，那么應該就是流產干凈了。

服用藥物流產后，見到明顯的妊娠囊及蛻膜組織排出體外，陰道少量間斷性的流血，3-7天干凈了，同時B超提示宮腔內沒有明顯的殘留，沒有下腹疼痛等明顯不適，表示藥物流產成功了，是完全流產，算干凈了。