如發生門靜脈血栓形成，應該進一步考察，造成這一傷害的因素有哪些，由腫瘤引起，或由血液疾病所致，再根據病因，給予系統治療。
另外一種情況就是由于凝血因子缺乏而造成的，也需要通過檢測和診斷之后再去解決。現在尚無特殊藥物治療，若因凝血功能異常所致，則此類血栓治療通常采用低分子肝素治療，還是華法林之類的處理，結果均為良好。另外，對于肝硬變和肝衰竭患者來說，可以選擇聯合用藥方式進行治療。也應引起重視，癥狀嚴重者，須在醫師指導下進行，用藥物治療。另外，還要定期對身體進行檢測，一旦發現肝功能不正常，就可以通過肝移植手術進行解決。同時留意是否有肝臟發生病變，如肝硬化，同時也需口服對肝細胞有保護作用的藥物治療以減輕癥狀。
另外，患者還要注意避免服用刺激性大的藥物，以免影響到患者身體機能和身體健康。平時要注意飲食，少量多餐，脂肪含量相對較多，適當運動以增強體質，增強自身抵抗力。
靜脈血栓通常是在醫生的指導下口服華法林，肝素，利伐沙班片等藥物。
還可以應用脈絡舒通丸，具有清熱解毒，化瘀通絡，祛濕消腫等功效。患者需要及時前往醫院就診，聽醫生建議選擇藥物和治療方法，藥物應在醫生指導下應用。治療期間患者要注意保持充足的睡眠時間，同時堅持清淡飲食，不要吃辛辣刺激性食物，增加營養的攝入，有利于身體恢復。
有靜脈血栓形成的病人，必須注意清淡飲食。
其間不要吸煙、飲酒，積極與醫師合作治療以減輕癥狀，也應重視靜脈血栓的形成，主要是由靜脈栓塞而產生，在此病例中，須查明栓塞發生的病因，針對病因對癥處理，以減輕癥狀。另外有些人還會出現其他類型的神經官能癥，如抑郁癥等。此外在飲食方面應盡量做到低鹽、低脂，以低糖飲食為主要原則，可食用新鮮水果和蔬菜，例如小白菜、油麥菜、菠菜、芹菜等，這一切皆有可能。此外還可酌情食用木耳山藥、香菇等，這一切還沒問題，喜歡吃辣，如辣椒、胡椒、芥末、蔥末、生姜等，蒜還是不吃為妙，較油膩食品，豬肉豬頭肉，這些還是不吃為妙。
脾靜脈血栓可以通過一般治療、手術治療等方法進行治療。
1.一般治療：作為肝硬化、門脈高壓進行脾臟切除后，脾靜脈出現的血栓，可以觀察，不必特殊處理。
2.手術治療：如果為肝硬化、門脈高壓，引起的脾靜脈回流受阻，局部血流減慢，常在脾靜脈出現明顯血栓。由于局部側支循環廣泛建立，進行門脈高壓手術即可控制病情。
通常情況下，靜脈血栓看血管外科。
血管外科是從普通外科逐步發展起來的，它是一個專門看血管疾病的科室，一旦確診為靜脈血栓，要根據病人的血栓部位、大小、范圍進行相應的處理，例如抗凝、溶栓等，同時，由于靜脈血栓的存在，很容易引發并發癥，例如下肢深靜脈血栓的病人，很可能會引發肺梗死，對病人的生命造成嚴重的威脅，需引起重視。