HPV會引起扁平疣，也會引起尋常疣，疣狀表皮發育不良，以及宮頸癌等病變；這個病毒很頑固，目前并沒有能直接殺死這種病毒的藥，只能通過增強免疫力；但很多人用了很多增強免疫力的藥照樣沒用的；原因是這個病毒本身具體偽裝功能，能降低局部的免疫力，讓人體免疫系統發現不了它。

扁平疣是由HPV中的亞型感染引發的一種皮膚良性增生，主要病毒類型為HPV2、3、4等，雖然具有傳染性，但不會引發癌變。扁平疣的治療方法主要有食療、手術治療和外用中草藥治療等方法。其中中草藥治療比較安全可靠。

扁平疣俗稱“扁瘊”，是由人類乳頭狀瘤病毒HPV3和HPV5感染引起的皮膚贅生物。好發于青少年，故又稱青年扁平疣。扁平疣有一定傳染性，有時由于搔抓將病毒接種在鄰近皮膚，呈沿抓痕分布的線狀排列。一般不痛不癢，有時微癢。病程較慢，有的可自然消退。由于扁平疣發病時間越長，越容易形成嚴重的色素沉著，且容易誘發其它嚴重后果，因此，扁平疣的治療要及時。

由于HPV感染引起的，屬于病毒感染，會通過接觸來傳播，會引起皮膚出現輕微瘙癢的癥狀，這個疾病如果免疫力下降很容易反復發作，所以很難治療好，可配合用一些免疫調節類的藥物。

扁平疣是HPV病毒中的某些亞型感染所致的一種良性增生性皮膚病，包括2、3、4、10、28、41、65幾個亞型，65是近些年新發現的一種致病亞型，會導致色素性扁平疣。此疾病具有傳染性，特別是密切接觸者更容易傳染，如近親屬之間傳染性較大。當它生長于面部時，有損儀表，并且會影響社交活動、人的心情，但是不會導致癌變。

扁平疣和宮頸HPV兩者無確切的關系，抵抗力低了防護措施不到位引起的病毒感染，積極治療就行。HPV檢查主要是對尖銳濕疣確定的，患部在陰部的話有可能換了尖銳濕疣的，其實扁平疣和尖銳濕疣都是人類乳頭瘤引起的，治療也可以用同一種藥物的。