造成性功能障礙的原因大致可以分成三類：生物因素、精神心理因素和文化因素。生物因素性功能障礙可能由遺傳、健康狀況、激素水平、年齡、疾病（包括慢性病、神經精神系統疾患、內分泌疾病、生殖器官病變）等多種原因所引起。藥物、長期大量酗酒或吸毒者，也會出現性功能障礙。

男性性功能障礙可能是海綿竇血管的功能受損、心理因素、早泄等原因導致的，具體分析如下：
男性性功能障礙的主要癥狀是陰莖勃起功能障礙和陽痿，海綿竇血管的功能損害是導致性功能障礙的原因之一，同時也要考慮到心理因素，PDE5抑制劑可以用于治療。還有一種是早泄，這是由于陰莖頭的敏感，或是由于射精的傳入神經過于激動，所以可以外用局部麻醉藥物，也可以口服5-羥色胺再攝取抑制劑達泊西汀。

性功能障礙疼多考慮是由于激素水平下降或陰莖海綿體充血障礙而引起的這種表現。另外與自身的體質、不良的生活習慣、生殖器疾病、藥物刺激、體內的性激素水平等因素有關系。

女性性功能障礙可能是社會心理因素、激素水平波動等原因導致的，具體分析如下：
1、社會心理因素，女人經常會因為工作、照顧自己的家人，或者是沒有得到足夠的關心，而情緒低落，出現性功能障礙。
2、激素水平波動，女人到了中年，尤其是到了絕經期，體內的雌性激素會迅速的降低，同時陰道周圍的上皮也會出現萎縮，這種情況很可能會影響到性功能。

導致性功能障礙的病因很多，如頻繁性交，吸煙，包皮過長，前列腺炎等都會引起，早泄如果沒有及時的治療，會嚴重挫傷男人的自信和自尊心，或影響到雙方的感情，同時也會影響到正常的生育和誘發陽痿，病因不同治療方法也不一樣，建議及時去正規醫院檢查，對癥治療。

男性性功能障礙，是因為自身長期的精神壓力，以及焦慮的心理出現的，包皮過長，使得包皮龜頭長期炎癥刺激，龜頭敏感性增強，久而久之，易產生性功能障礙。身體素質下降內分泌失調也會引起性功能障礙。