肉芽腫性前列腺炎發病與局部強烈的異物反應有關。前列腺導管阻塞是首要因素，原因包括細菌感染引發的炎癥過程或外科創傷造成的組織壞死，前列腺增生也可能造成或加重前列腺導管的梗阻。感染和炎癥破壞導管和腺體上皮，細胞碎片、細菌毒素和前列腺分泌物進入組織間隙，成為基質內異物，激發肉芽腫性炎癥反應。

肉芽腫性前列腺炎是一種非特異性的、多種組織模式的炎癥。與局部強烈的異物反應有關。引起的首要因素是前列腺導管阻塞，包括細菌感染引發的炎癥過程或外科創傷造成的組織壞死，前列腺增生也造成或加重前列腺導管的梗阻。

肉芽腫性前列腺炎主要是以下原因引起的：
1、泌尿道反復感染：泌尿道反復感染，造成炎癥反應，造成導管阻塞。床上，約70%的患者都有過泌尿系統的感染。
2、醫源性泌尿系統損害：前列腺炎多發生于術后半年，經尿道部分切除、前列腺穿刺活檢、膀胱腫、卡介苗灌流等。
3有明顯的全身癥狀，常見的致病微生物有真菌、結核桿菌、布氏克魯斯菌、梅毒螺旋體等。
4、系統性疾病：全身性肉芽腫病的病人，身體的各個器官都會出現肉芽腫性結節，一旦上皮細胞受損，就會有細菌毒素和前列腺分泌物進入人體，從而引發前列腺炎癥，從而形成肉芽腫性結節。

獨身或長期禁欲者，前列腺分泌液大量積聚，性生活時經常中斷性交，強行壓抑不射精。使分泌物淤積和充血。大量飲酒，吃酸辣等刺激性食物，可使盆腔和前列腺充血。受潮、受涼、長期坐位，感冒等，都可引起前列腺充血。

肉芽腫性前列腺炎的發病與局部強烈的異物反應有關。前列腺導管阻塞是首要因素，包括細菌感染引發的炎癥過程，或外科創傷造成的組織壞死，前列腺增生，也可能造成或加重前列腺導管的梗阻。

非特異性占70%，常繼發于近期的尿路感染，特異性占3%。病原微生物包括細菌、結核菌、布氏桿菌、梅毒螺旋體、病毒及真菌等。其中膀胱腫瘤電切術后灌注卡介苗并發肉芽腫性前列腺炎受到廣泛重視，作為膀胱灌注卡介苗的并發癥其發病率為0.9%～1.3%，僅次于膀胱炎和發熱的發病率。