孕期盡量不接受核磁共振檢查。如需明確診斷，亦可進行核磁共振檢查，但在妊娠早期，即妊娠頭3個月內，盡可能不進行核磁共振檢查。
由于在懷孕早期，胎兒各臟器都處于發育成熟階段，是致胎畸形敏感期，妊娠中晚期可進行核磁共振檢查。如妊娠中晚期，胎兒側腦室寬大，一般不超過1.0厘米，如果超過1.5厘米的話，彩超即可確診為腦積水；
若側腦室寬度為1.0~1.5厘米，則需核磁共振來明確胎兒畸形及去留。

在孕期除非有必要，一般不能做磁共振的，因為磁共振有一定的輻射性，做了之后是有可能會影響胎兒發育的，嚴重時會導致胎兒發育出現畸形。但如果胎兒發育存在問題，其他的檢查又檢查不出來，在權衡利弊之后，是可以在醫生的安排下做磁共振的，主要是排除胎兒有發育畸形的可能，或者是看一下胎兒的發育情況。

核磁共振后可以立即懷孕。
目前并沒有發現做核磁共振會對懷孕產生任何影響，所以在進行核磁共振后可以立即備孕。因為女性懷孕需要一段時間，并不是同房后立即就能懷孕，所以基本是不會受到核磁共振的影響的。女性如果有生育計劃，最好提前半年進行備孕，補充身體懷孕所需的各種營養和維生素，比如葉酸。并養成良好的生活習慣，避免熬夜和勞累。

磁共振有較高的軟組織分辨率，而且可以多方位成像，能夠輕很好地顯示胎兒的顱腦結構，是產前診斷胎兒頭部疾病的重要手段之一。磁共振沒有輻射，對胎兒和孕婦沒有輻射損傷，不會造成胎兒畸形，所以檢查是安全的不接觸x光射線，沒有輻射性的，所以對胎兒影響不是很大的，不用太擔心，可以考慮保留胎兒的。平時多注意休息，后期做好常規性的產檢措施，做好各項排畸檢查。平時飲食要全面多樣化，避免偏食和挑食。

核磁共振無論是對孕婦，還是對胎兒，都沒有任何不良影響，所以在做了核磁共振后，根本不需要延長備孕時間，而是可以馬上備孕懷孕。因為核磁不會影響卵子，或者精子的質量，更不會影響受精卵的生長發育。

做完核磁共振，如果不著急懷孕，可以等三個月。核磁共振對人體的輻射也是相當大的，女性在備孕期間，是不能夠做核磁共振檢查的，因為做完檢查之后，體內會殘留放射線，對懷孕也是有不利影響的，容易造成畸胎。