生理性尿分叉，主要是由于尿道或尿道開口處臨時有阻塞，男性射精后因部分精液還殘存在尿道中，海綿體充血尚未完全消失，導致尿流不暢。病理性尿分叉是經常的或長期的排尿分叉，很可能與一些疾病相關。長期尿分叉大多由于后尿道或尿道口處狹窄，或因慢性炎癥后形成瘢痕，導致尿液不能通暢排出。急性尿道炎、前列腺炎期間，由于尿道充血、腫脹、分泌物增多，可影響尿流的通暢而出現分叉現象。

尿分叉的原因與尿道粘膜不光滑（如炎癥、新生物）、尿道存在分泌物、尿道口不規則等因素有關，可以見于前列腺炎、前列腺增生，尿道炎、疤痕、尿道口異常等。所以引起了尿道尿液動力學發生了改變而導致尿分叉。

一般在排尿的時候排尿一般是呈直線的，如果有尿道狹窄或者炎癥，尿道充血的情況下，一般會出現尿不暢或者尿分叉的癥狀，而且泌尿系常見的疾病主要見于良性的前列腺增生，尿道狹窄泌尿系結核等均可引起尿分叉。

尿分叉是因為尿道阻力的增加導致，另外還有生理因素也會導致尿分叉，比如早起排尿時由于膀胱聚集大量尿液，排尿時尿道外口可能暫時閉合引起排尿分叉，這是一種正常的生理現象，不需要治療，常見的男性患者就是前列腺炎、前列腺增生，由于前列腺炎導致的尿道水腫，可以引起尿道阻力增加，引起排尿分叉。

男人尿分叉主要是前列腺炎導致的。
前列腺炎一般由致病菌感染或某些非感染因素所引起的，前列腺炎通常以會陰部、腰骶部和腹股溝區疼痛為主述而就診，主要表現為尿頻尿急、尿痛、尿分叉、尿滴白、排尿困難、夜尿增多等，也可出現射精疼痛、血精或全身癥狀。建議患者按照醫囑使用氨芐西林膠囊、復方地西泮片、塞來昔布膠囊等藥物進行治療。

男性尿分叉可能是前列腺疾病或腎病引起的。
尿分叉屬于排尿困難一類。其發病機理是膀胱內尿液不斷地從一個或幾個管口排出而導致壓力增高，引起神經反射出現間歇性痙攣性疼痛。可呈現小便有兩股或三股或噴壺樣。其發病機制主要是膀胱內壓力增高引起尿液不能正常排出而產生的一種癥狀。常見病因為尿道結石，前列腺炎等、前列腺增生，前列腺充血等癥狀。在臨床上還存在一些癥狀不明顯或沒有癥狀但尿動力學異常患者，如慢性腎盂腎炎、糖尿病腎病、腎功能不全以及高血壓等疾病患者。需去醫院做尿常規、泌尿系彩超相關的檢查以確定原因。原因清楚，可用相應治療藥物治療。