該病主要與痰瘀有關，痰濁阻遏經脈影響沖任致使經血不調，運行不暢胞，宮失養痰濁阻滯氣機升降，影響水液代謝痰瘀是產生子宮內膜異位癥癥狀和體征的關鍵所以，要慎重根據自身的狀況來選擇治療，治療時需要去正規大醫院。

要去治療巧克力囊腫的專科醫院，或者是治療囊腫的專科醫院都可以，這些醫院的設備和儀器，都比較先進，而且，大夫的經驗，相對來說比較豐富，更利于治療巧克力囊腫的治療和效果。

巧克力囊腫要到正規的三甲醫院進行診斷，根據不同的病情來制定合理的治療方案，接受系統、科學的治療，只有對癥治療才會提高治好的幾率，千萬不要盲目去治療，以免加重病情。

去專業正規的醫院進行檢查和治療，遵醫囑用藥。盡量吃清淡一點，要忌生冷和茶。個人的衛生習慣也很重要，內衣勤洗勤換。多用開水燙洗然后放在太陽底下暴曬。保證良好的作息，不要太晚睡覺。

需要三個月左右才能治好。巧克力囊腫是子宮囊腫的一種，屬于良性病變，會伴隨有增生、轉移、復發等情況的出現，而且會造成痛經、月經失調等，因此建議還是及早治療比較好，需要服藥三個月左右進行鞏固治療，另外需要隨時復查。

巧克力囊腫的復發幾率還是非常高的。在臨床上，如果巧克力囊腫的病人術后沒有給予相應的干預，絕大多數都會出現復發的情況。主要是因為巧克力囊腫由具有活性的子宮內膜細胞種植在卵巢，才引起的這種囊腫，手術很難把這種活性細胞完全根除掉，所以就會復發。