目前還沒有專門的理論來解釋卵巢囊腫的原因，但一般和遺傳因素以及個體因素有關。
1、遺傳因素：女性或外祖母患有卵巢囊腫的后代更容易得卵巢囊腫；
2、個體因素：正常發育時出現的良性囊性腫瘤，比如卵巢畸胎瘤。所有的患者都有不同的原因。
女性在做卵巢囊腫的時候，可以主觀的觸摸到附件區囊性腫物或者是包塊。通過B超、彩超等檢查，可以明確腹前區是否有囊性腫塊，具體的可以通過磁共振和CT檢查來明確。

巧克力卵巢囊腫一般指子宮內膜異位囊腫。通常情況下，子宮內膜異位囊腫目前為止病因還不清楚。子宮內膜異位囊腫是指卵巢內的異位子宮內膜組織周期性反復出血，形成被卵巢實質包裹的血腫，當具有活性的子宮內膜細胞種植在卵巢局部的時候，隨著每次來月經異位癥的病灶，在卵巢內也會出現出血的現象，患者可以通過囊腫剔除術、囊腫穿刺術、卵巢切除術等方式進行治療。

卵巢囊腫引起的癥狀有小腹疼痛、小腹不適、白帶增多、白帶色黃、白帶異味、月經失常，而且通常小腹內有一個堅實而無痛的腫塊，有時性交會發生疼痛。當囊腫影響到激素生產時，可能出現諸如陰道不規則出血或毛體增多等癥狀。囊腫而發生扭轉，則有嚴重腹痛腹帳、呼吸困難、食欲降低、惡心及發熱等。較大的囊腫會對膀胱附近造成壓迫，引起尿頻和排尿困難。

卵巢囊腫分為卵巢生理性的囊腫和卵巢病理性的囊腫，生理性的囊腫也就是正常的月經中期出現的卵巢黃體囊腫。生理性囊腫顧名思義是正常的生理現象，不用做特殊的處理，隨著月經的結束，卵巢生理性的囊腫都會自然地萎縮、吸收，不必做特殊的處理。病理性的囊腫病理類型是不一樣的，包括卵巢漿液性囊腫和卵巢黏液性囊腫等。

如果由于炎癥引起的卵巢囊腫，再抗炎治療，以后大部分都會消下去的，就是如何判斷這個卵巢囊腫，很難判斷，所以說，如果有卵巢囊腫，在月經干凈3到5天做b超，如果有，并且持續三個月，卵巢囊腫直徑大于三公分，可以手術治療。

引起卵巢囊腫有炎癥的因素，但不是主要原因。主要原因是由于一些婦科疾病所以及時治療導致了卵巢囊腫。所以需要去正規的醫院做相關的婦科檢查，進一步制定治療計劃。然后配合治療。