巧克力囊腫與中醫的氣滯血瘀有關，與宮寒，或是濕熱的炎癥引起的血瘀有關，需要中醫把脈或四診辨證檢查診斷，進行治療，主要是以活血化瘀，把巧克力囊腫消散掉，或是使月經調順，月經正常，經來不痛。

巧克力囊腫應該在中醫指導下服用中藥治療。在用藥以后需要去醫院做B超復查，如果再恢復正常，不需要進一步治療。如果用藥效果不理想，也可以去醫院做腹腔鏡的微創手術治療。

一般是從整體的觀念入手進行治療，活血化瘀，軟堅散結，疏肝理氣，扶正固本，清熱解毒等全面的調節女性內分泌，在治療一段時間后氣行血活，臟腑通順。中醫治療巧克力囊腫最明顯的優勢就是不開刀，副作用比較小且在治療后復發率是比較低的。

去專業正規的醫院進行檢查和治療，遵醫囑用藥。盡量吃清淡一點，要忌生冷和茶。個人的衛生習慣也很重要，內衣勤洗勤換。多用開水燙洗然后放在太陽底下暴曬。保證良好的作息，不要太晚睡覺。

中醫治療卵巢巧克力囊腫以疏肝理氣，扶正因本，活血化瘀，軟堅散結，清熱解毒為治療思路。由于氣血是肌體的物質基礎，而臟腑為氣血生化之源，分管氣血的生成、統攝和運行。但中醫治療卵巢巧克力囊腫，并不是所有人都適用，具體還需要根據實際病情來看，因此女性朋友患有卵巢巧克力囊腫，一定不要盲目接受巧克力囊腫的治療，需要去正規的醫院聽取專業醫師囑咐在考慮。

中醫通息療法。通息療法：通過激活和增強人體的免疫系統（包括體液免疫和細胞免疫）使其增加體液免疫對致瘤因子的監控，促進淋巴細胞、單核吞噬和巨噬細胞對瘤體組織的吞噬作用，糾正導致瘤體的內環境調節，內部調理與穴位治療相結合，局部治療與整體調節相補充，從而達到標本兼治的原則，直通病灶，達到治病求本、標本兼治的治療效果。