囊卵巢的女性會有體內雌激素水平降低、雄激素水平升高，則會影響卵泡的生長發育情況，所以能夠自然懷孕的概率很低。而且即使在懷孕之后，由于雌激素水平不高，所以也會增加先兆流產的風險，在確定懷孕之后要注意及時檢查。

多囊卵巢懷孕了流產了可能是因為高雄激素水平、胰島素抵抗(IR)與高胰島素血癥、高促黃體生成素(LH)分泌、子宮內膜受損等因素都可能引起自然流產或者胎停育。如果沒有保胎措施，多囊卵巢懷孕后流產或胎停的幾率較高，達到25%~37%。