沙眼衣原體感染的治療目的是治療感染，防止產生合并癥，阻斷進一步傳播。治療原則是早期發現早期治療，足療程足量用藥，性伴侶須同時治療。要勤洗澡，不提倡洗盆浴，衣物要單獨存放；要經常換洗內褲，特別是新內褲或長久不穿的內褲，穿之前要清洗晾曬；穿透氣好、吸濕性強的棉織品內褲，盡量少穿緊身褲或牛仔褲，多穿透氣性好的裙裝，這對保護女性身體健康是非常重要的。
沙眼衣原體尿道炎能根治。
沙眼衣原體尿道炎屬于是非淋性的尿路感染，大多數是可以治好的，要積極配合醫生進行治療。確診后，患者需要遵醫囑采用廣譜抗生素治療，并且要規則、定量、徹底治療，要連續不間斷用藥，才能夠達到根治的效果。患者還要做好日常護理，保持局部清潔衛生。
沙眼衣原體是男性尿道的常見致病菌，潛伏期1～3周，臨床表現為尿道粘液性或粘液膿性分泌物，并有尿痛、尿道不適等癥狀，急性發作時尿道口發紅的，可以提取分泌物進行化驗，選擇敏感的抗生素，在藥物治療的同時，要保持個人的清潔衛生，大量飲水，在藥物治療的同時，最近的飲食要以清淡為主，不可以吃辛辣刺激性食物。
尿道炎常見癥狀有尿頻、尿急、尿痛，可有尿道分泌物，初始為黏液性，后多有量膿性分泌物。宮頸炎主要癥狀為陰道分泌物增多，呈粘液膿性，陰道分泌物的刺激可引起外陰瘙癢，伴有腰酸及下腹部墜痛。
飲酒會導致尿道炎癥的惡化，不存在易感性的情況下飲酒并不會導致尿道炎。因此，在平時一定要做到戒煙戒酒，并且要在醫師的指導下使用敏感性的藥物來進行抗菌藥物。患者平時要多飲水，每天尿水量在2000ml以上，平時要多排尿，盡量不要憋尿，保持2個小時左右排尿一次，尿液對尿路有很好的沖洗效果，有利于細菌等的排出，有利于身體的康復。在日常生活中要多吃一些新鮮的蔬菜，避免食用辛辣刺激的食品。日常的作息要有一定的規律，在急性期要多注意多休息，保持良好的個人清潔，在治療過程中盡量不要同房。
