主要病因包括：①食滯：小兒臟腑嬌嫩，加上飲食不知饑飽，易傷及脾胃，造成“食滯”，“脾胃不和”，運化功能失調，出現厭食。②脾濕：歷夏季，暑濕之氣偏盛，濕邪內侵，脾被濕困，運化受阻，引起厭食。③先天不足、元氣虛弱：因早產或其他原因，使小兒發育不成熟，小兒先天元氣不足，腎氣不充，脾胃功能虛弱，運化無權，發生厭食。④脾胃虛弱：因重病或久病，正氣虧乏，傷及脾胃，脾失健運，引起厭食。
小兒厭食癥主要缺鋅有一定的關系的。厭食癥因為長時期食欲不振、看到食物也不想吃、甚至拒吃，這種情形連續兩個月以上，如此，才符合所謂的“厭食”。小兒厭食癥首先要排除孩子有無感冒或內科慢性疾病、消化道疾病等疾病。給孩子吃些補鋅的。
寶寶厭食癥是指長期的食欲減退或消失、以食量減少為主要癥狀，是一種慢性消化功能紊亂綜合征，是兒科常見病、多發病，1-6歲寶寶多見，且有逐年上升趨勢。常用的推拿方法是清板門100次、逆運內八卦100次、推四橫紋100次、捏脊6遍、退六腑100次、揉合谷100次。
注意飲食合理搭配。小兒生長發育所需的營養物質要靠從食物中攝取，但對這些營養素的需要并不是等量的，注意各營養素間的比例，以求均衡飲食。每天不僅吃肉、乳、蛋、豆，還要吃五谷雜糧、蔬菜、水果。每餐要求葷素、粗細、干稀搭配。
一般來說，小兒厭食癥可以通過以下方式預防。具體分析如下：
第一，改善飲食習慣，盡量避免吃油炸，膨化食品，巧克力等高卡路里食物，可以吃新鮮的水果和蔬菜。
第二，要注意小兒有沒有缺鋅，因為鋅會對味蕾的細胞再生及分泌的粘多糖產生一定的抑制作用，從而引起食欲減退、食欲減退、食欲減退，需要適當補充牡蠣、扇貝、蛋黃等含鋅量較為豐富的食物。
日常生活中，家長應當注意保持環境清潔，盡量減少在粉塵、煙霧及其他刺激性環境中停留。