一般情況下，寶寶霉菌性腸炎，可以通過以下幾種方式進行治療。具體情況分析如下：
1.需要進行相應的輔助處理，如果是霉菌性腸炎，會導致大便的數量增加，導致體內的脫水和電解質出現問題，需要通過服用補液鹽來進行補充。
2.還可以服用益生菌，比如霉菌性腸炎，主要是由腸道菌群失調所致，可以使用益生菌進行調理。
3.還可以口服氟康唑，這類藥物主要用于治療霉菌，具有一定的抑菌效果。

主要是考慮不注意清潔衛生，進食不潔食物引起的腸道感染，主要是霉菌等引起的。可以要對癥治療，可以使用殺菌藥物，殺滅霉菌等，促進腸道有益菌群生長，平時餐具要消毒，注意清潔衛生。

嬰兒霉菌性腸首先需要給予止痛的藥物治療，因為確診是由于腸炎而引起的。有腹部疼痛不適的癥狀，需要給予禁食，然后靜脈給予營養支持治療。嬰兒沒有.惡心嘔吐的癥狀，可以進食一些流質飲食和收斂的藥物治療。一周左右的時間，癥狀就會逐漸地好轉。

小兒霉菌性腸炎治療首先要查找原因，如果是由于營養不良、應用抗生素、激素等藥物不當，造成了腸道內菌群失調，治療上宜速停用抗生素和激素。以免病情加重，另外要加強營養支持治療，需要到公立醫院兒科住院，進行規范化治療。

霉菌性腸炎可以服用中藥或消炎藥治療，也可以通過手術治療。
服用中藥治療。中藥的藥性是比較溫和的，有一些中藥材也是具有殺菌消炎功效。服用消炎藥。目前治療炎癥最好的方法就是服用消炎藥來進行治療。如果患者患有霉菌性腸炎，就可以服用一些具有抗霉菌感染的消炎藥來進行治療，可以快速的將患者腸道中的霉菌消滅掉。因為霉菌的繁殖速度是比較快，也可以通過手術來治療。
建議:吃一些清淡容易消化的食物，盡量不吃辛辣、刺激性的食物，避免給腸胃增加負擔。可以多鍛煉運動，增強體質。

霉菌性腸炎患者應該通過靜脈補液來進行治療。
能夠補充身體內所需要的水分，同時也可以避免患者出現水電解質紊亂和脫水現象。霉菌性腸炎主要是受到霉菌感染所引起，在發病以后患者會出現腹瀉和下腹部疼痛，同時還會伴隨著大便不成形或者是腫脹的現象，對自身健康產生影響。
在治療的過程中應該注意休息，避免過度的勞累，要定期到醫院復查腸鏡，能夠了解病情恢復情況，避免病情加重。