人體一般無明顯的危害。如有幽閉恐懼癥，進行核磁共振檢查時，可能會出現恐懼和躁動，可能造成危害；由于核磁共振機器會產生巨大噪聲，尤為進行梯度切換時，如聽力非常敏感的患者進行核磁共振檢查，可能會造成心理影響。

核磁共振是通過核磁共振來檢測人體的內臟，不會產生輻射，所以不會對人和大腦造成危害，甚至連嬰兒都不會造成危害。核磁共振的時候，身體要保持平穩，正常的掃描要20分鐘，如果要做X光或者做血管造影，則要花費更多的時間，所以，寶寶只能在睡覺的時候做，或者是在睡覺的情況下使用鎮定劑，這樣才能讓手術成功，影像清晰，結果也更加可信。

嬰兒進行核磁共振通常是沒有明顯危害的，可以在醫生指導下正常進行，無需特別處理。
對于嬰幼兒來說，核磁共振是一種非常安全的檢查方法，是一種使用高場強磁場進行檢測的儀器，通常不會對人體造成任何的傷害，在臨床上是一種常用的檢查方法。但是磁共振檢查耗時較久，噪聲較大，嬰兒可能不能配合檢查，要先進行鎮靜。需要注意的是，當通過磁共振發現幼兒患有某些疾病的時候，最好是可以盡快的進行治療，并且在選擇藥物的時候也應該要慎重。

核磁共振后可以立即懷孕。
目前并沒有發現做核磁共振會對懷孕產生任何影響，所以在進行核磁共振后可以立即備孕。因為女性懷孕需要一段時間，并不是同房后立即就能懷孕，所以基本是不會受到核磁共振的影響的。女性如果有生育計劃，最好提前半年進行備孕，補充身體懷孕所需的各種營養和維生素，比如葉酸。并養成良好的生活習慣，避免熬夜和勞累。

頭疼拍ct比較好。頭痛是日常生活中的常見癥狀，CT檢查較實惠，較低費用即可解決部分較大的問題，如是否存在腫瘤或出血等，且大部分引起頭痛的原因通過CT檢查即可解決；若出現神經痛或顱腦神經壓迫病變，MR檢查效果更好，但MR收費相應較高。若患者出現頭痛現象，醫生將根據頭痛不同的性質、部位、癥狀安排不同檢查。若患者為持續、反復跳痛，且疼痛遷延不愈，則應進行磁共振檢查觀察神經的情況。引起頭疼的原因是比較多的，建議根據頭疼的原因進行選擇，可以在醫生指導下進行相關檢查，確診后治療。

懷孕期間可以進行核磁共振檢查，因為孕婦有肥胖、羊水不足、胎兒已經進入盆內，或者是產前超聲無法確認的情況。
可以為胎兒胃腸道和消化道的異常情況提供更多的補充資料。建議孕婦和家人不要害怕核磁共振會產生輻射，也不要擔心會對胎兒的發育有什么影響。在懷孕的3個月內，胎兒正處在細胞的分化發育階段，因此要避免做核磁共振。