腦炎的后遺癥主要有：1、腦炎累及人體運動神經，引發運動功能障礙，導致四肢無力、活動能力受限的后遺癥；2、腦炎發病部位本來就屬于大腦，因此更容易損害大腦神經引發智力障礙；3、疾病累及語言神經，引發失語后遺癥；4、眼球麻痹也是腦炎的后遺癥之一，由于這種疾病也容易讓視覺神經受損；5、腦炎也容易引發肌肉萎縮的后遺癥。

治療這種病的專科醫院。腦炎后遺癥，只有恢復大腦神經功能，病情才會明顯好轉，病情穩定后，鼓勵病人做主動鍛煉。盡早下床活動，從起床、患肢平衡、站立、行走進行訓練指導，逐步增加活動范圍和次數，最后幫助進行上下樓梯訓練，讓患肢得到運動，利于功能的恢復。

專科醫院。這些個醫院都是集國際、醫療、教學、科研、預防交流五位一體的三級甲等綜合性醫院。近幾年來，醫院也實現了跨越式發展，涌現了一批特色醫療項目，醫院的整體規模也在不斷的擴大。

腦炎后遺癥一般不會自愈，一定要掌握一些治療的方法，要針對不同的后遺癥表現，采取相應的治療，綜合治療是比較好的辦法，可以在服藥期間做一些有氧運動，對于治療有好處。

兒童腦炎后遺癥癥狀多為一側上肢癱瘓或雙上肢癱瘓。意識障礙，甚至去皮質狀態等不同程度意識改變，顱壓增高癥狀，多數可完全恢復，但少數遺留癲癇、肢體癱瘓、智能發育遲緩等。

可以通過表面的癥狀檢測包括發熱、煩躁不安和進行性加重的意識障礙。隨病情加重患兒逐漸從神萎、嗜睡、昏睡、昏迷到深度昏迷。如果不確定還可以檢查血象、補體結合試驗等。