嬰兒肛周膿腫可能是激素水平過高、肛門腺體數量較多、肛竇炎等原因引起的。
1.激素水平過高：嬰兒患肛周膿腫的高峰期是出生后1-2個月，男寶寶患肛周膿腫的概率更高，出生3個月內的男寶寶睪酮水平較高。
2.肛門腺體數量較多：肛門腺體可分泌粘液，潤滑直腸。孕期母體內雌激素水平升高，可使嬰兒肛門腺體數量增多，大便次數較多。排便時細菌性稀便進入腺體，可引起感染，出現肛周膿腫。
3.肛竇炎：患兒肛門括約肌收縮時，體內炎性分泌物排泄受到影響，擴散至直腸、肛門周圍時，就可能形成肛周膿腫。
肛周膿腫是指直腸肛管組織內或其周圍間隙內的感染，嬰幼兒抵抗力差容易被感染，家長平時要注意孩子的衛生，保持私處的清潔，勤給孩子洗澡換衣服，不要讓孩子到處隨地亂坐。
肛周膿腫是由于肛腺感染引起的，由于肛竇開口向上，像口袋一樣，可以存留糞便，容易引起肛竇發炎，感染蔓延至肛腺后導致括約肌的肌間感染，從而引起各種類型的肛周膿腫。需要到醫院就診。
肛周膿腫形成的原因多數是由于肛竇炎感染未得到及時控制，而波及到肛門直腸周圍軟組織，從而形成局限性膿腫。肛竇一旦感染后，會引起肛門腺感染化膿，炎癥向肛周間隙內擴散形成肛周膿腫。
小兒肛周膿腫的原因主要為出現肛隱窩細菌感染，或者是便秘引起的。
小兒肛周膿腫可能是因為小兒的身體還處于發育期，肛隱窩尚沒有發育完善，大便或者細菌進入肛隱窩以后，返回的可能性很小，造成腫脹。如果小兒經常出現便秘，或者稀便的情況，因為小兒的身體抵抗力較低，大便或者腸液物質容易在肛周反復摩擦，滋生細菌，引起肛周膿腫的情況。