反復腸炎應及時進行抗感染治療，抗生素治療是由細菌感染引起的腸炎。
如果是由病毒感染引起的腸炎，需要加強孩子的免疫力，日常生活中要注意避免食用生冷的食物，避免食用不易消化的食物，避免影響孩子的脾胃功能，同時要加強身體的免疫力。
如果是細菌感染的腸炎，建議在醫生的指導下應用抗生素進行抗感染治療，三次以上的大便常規沒有白細胞和膿細胞，才能停止抗感染治療。
小兒慢性腸炎老反復，家長要注意護理。
慢性腸炎最明顯的特征就是病程較長，而且很容易復發。生活中要讓孩子保持良好的心態，不要受到精神刺激，緩解心理上的壓力。同時要注意衣服的保暖，多運動，加強身體。飲食上要注意多吃一些柔軟、易消化、營養豐富、熱量充足的食物，同時要注意多吃維生素、少吃生冷、油膩的食物。慢性腸炎患者不能吃有氣的食物，因為這種疾病會反復出現潰瘍和疤痕纖維，從而使結腸的彈性下降，吃豆制品、炒蠶豆、白薯等易引起腸道內氣體充盈，從而出現急性腸膨脹、潰瘍穿孔等并發癥。
如果診斷為兒童的偽膜性腸炎，首先要在醫師的建議下口服抗生素。可以有效地抑制炎癥。如果病情很重，還可以進行輔助治療。偽膜性腸炎患者需要及時的進行治療，避免兒童體內的水電解質失調，否則會對兒童的身體造成很大的傷害，需要及時進行糾正。
在日常生活中，家長應注意讓小孩子保持清淡飲食，避免食用辛辣刺激的食物，防止病情加重。
發生細菌性腸炎需要針對性地進行消炎，如果癥狀比較輕微的，可以選擇口服藥物，如果腹瀉癥狀比較嚴重的，采用輸液，細菌性腸炎容易出現發熱的情況，需要密切觀察體溫變化，及時給予退熱處理。
小兒慢性腸炎的發病率很高，一般是因為病毒感染而導致的，一般情況下，小兒慢性腸炎的治療主要根據病毒和非侵入性細菌來判斷。
臨床表現出明顯的中毒癥狀，尤其是新生兒、嬰幼兒、重癥患兒可選用抗生素。抗生素不能治療由病毒引起的腸炎。治療由寄生蟲引起的腸炎需要服用一些抗寄生蟲的藥物。可以適當選擇胃腸粘膜保護劑和微生態治療。
