生理性腹瀉應該對孩子增強護理，大便之后及時清洗臀部，抹上爽身粉，保持皮膚干爽，避免引發濕疹或者局部的感染。
對于明顯腹瀉的患兒，腹瀉次數較大可以換用免乳糖奶粉。但如果腹瀉較輕，建議繼續母乳喂養，可適當補充鋅劑、微量元素，生理性腹瀉是由寶寶對乳糖不耐受所引起的，這種情況到1歲左右就會自然痊愈，一般不需要特殊治療。

一般情況下，幼兒生理性腹瀉通常不是疾病。如果幼兒的生理性腹瀉的情況不是很嚴重，家長不用過于擔心，這種情況通常不用進行特殊治療，一般繼續正常進行母乳喂養即可，但需要注意幼兒的身體情況。如果幼兒生理性腹瀉的情況比較嚴重，且長時間未得到改善，家長應及時帶幼兒去醫院就診，在醫生指導下給其口服蒙脫石散等藥物進行治療。

生理性腹瀉應當采取以下措施。
生理性腹瀉是因為母乳中含有一些能夠抑制乳糖酶的物質，導致孩子對乳糖的不耐受，導致出現了腹瀉。如果無其他不適癥狀，一般無需進行特殊治療。如果病情較為嚴重，可以在醫生的指導下進行治療，從而幫助緩解不適癥狀。
日常生活中，應當注意多飲水，多食用蔬菜和水果，飲食中適當增加纖維素。

生理性腹瀉是不需要打針吃藥的，如果是母乳喂養的，建議喂奶的時候每次都喂兩邊，不要因為吃一邊都吃不完就只吃一邊，后奶的營養比較豐富，如果攝入后奶很多的話會加重生理性腹瀉癥狀。

如果腹瀉過多，可以適當加用收斂劑或中藥。若非必要，盡量還是少用或者不用藥。對于明顯腹瀉的患兒，腹瀉次數較大可以換用免乳糖奶粉。但如果腹瀉較輕，建議繼續母乳喂養。

這個生理性腹瀉一般常見于小于六個月的寶寶，母乳喂養的常見的，這個大便可為稀便，無粘液膿血，一日數次~10余次不等，不伴有發熱、嘔吐、腹脹等癥狀，糞便常規檢查無異常。寶寶精神好，吃奶好，體重穩定增長，不影響生長發育，這樣的情況下一般無須治療，添加輔食以后就可以改善的。