在新生兒和嬰幼兒時期，大部分患兒沒有明顯的臨床表現，有的表現為輕度的黃疸，有的會表現為黃疸加重、黃疸消失推遲、睡眠減少、哭鬧、納呆、吮吸能力弱、皮膚有斑點、臉型腫脹、胸圍增大、便秘、腹脹、臍疝、心跳減慢、心音低沉等。中樞性甲減伴有其它的垂體促荷爾蒙失調時，會出現低度的葡萄糖、小的、隱睪、面中線的畸形，例如：唇裂、腭裂、視神經等。
兒童期甲狀腺功能減低：表情呆板，鼻扁寬，鼻梁下陷，兩眼距離遠，眼泡腫脹，嘴唇厚并向前突出，舌頭增大，聲音嘶啞，牙齒不長或稀少，個子不長或長得很慢，智力發育極差，只能照顧自己吃飯、大小便。這就屬于甲狀腺功能減低的癥狀癥狀。
甲狀腺功能減退癥，簡稱甲減，是由于機體甲狀腺激素合成和分泌減少或甲狀腺效應不足所導致的機體代謝降低的疾病。該病常累及身體多個系統，主要癥狀有臉色蒼白、顏面部浮腫、神情淡漠、皮膚干燥、毛發脫落、體重增加、記憶力減退、智力下降、嗜睡、全身乏力等癥狀。
亞臨床甲減患者通常無特殊表現，因此造成亞臨床甲減病人診斷病情，常因查體時被查出。
亞臨床甲減常發生于女性，男性相對較少。亞臨床甲減者，若癥狀較明顯，會有和甲減一樣的癥狀，如感覺無力、困倦、反應遲緩等，會出現便秘，皮膚干燥，粗糙，毛發干枯，脫落。有些病人可有三分之一眉毛以外的部分脫落，許多病例合并高胡蘿卜素血癥，病人表現為手和腳呈姜黃色。此外還容易出現惡心嘔吐等情況，還有一些人會出現貧血。測試病人肝功，還可發生肝功能異常，血脂可有高脂血癥。
甲減癥狀一般不會自行消失。
患者可能會出現怕冷、反應遲鈍、心動過緩、便秘、腹脹等癥狀，嚴重時會影響月經正常，甚至導致不孕不育。甲減需要用甲狀腺激素替代治療。可以先從小劑量開始，定期檢測甲狀腺功能，在醫生的指導下逐漸增加，直到甲狀腺功能恢復正常。部分患者經過一段時間的治療，可能會逐漸減量甚至停藥，達到臨床治愈。大多數甲減患者最終可能需要終身應用甲狀腺激素治療。