甲狀腺功能亢進術后的主要并發癥有呼吸困難、喉返神經的損害、喉上神經受損、手足痙攣、甲狀腺的危征等。
一、呼吸困難，其病因為：創面出血壓迫氣管、喉頭水腫、氣管塌陷等。
二、喉返神經的損害，是由外科醫生造成的。比如：割傷、縫扎、牽拉引起的。
三、喉上神經受損。
四、手足痙攣。在外科手術中，由于不正確地移除了副甲狀腺，使其甲狀腺機能減退，從而導致了手足痙攣。
五、甲狀腺的危征。手術后可能會出現甲亢的情況，主要是因為手術前沒有充分的準備，導致甲亢的出現。

甲亢手術后的并發癥如下：
一、術后呼吸困難：這是術后48h以內最嚴重的一種并發癥。
二、喉返神經損害：因外科手術的直接傷害，例如切口、縫合、錯位、牽扯等，也有少部分是因受血腫的擠壓或瘢痕的牽引所致。
三、喉上神經損害：在切除上、下端切除上、下端的時候，因不小心分開而造成的。
四、手足痙攣：因手術導致的副甲狀腺被摘除。

甲亢術后的并發癥有兩種，一種是由損傷引起的，一種是由甲狀腺機能改變引起的。
術后會造成喉返神經受損，可能會有嗓子沙啞，也可能會有吞咽障礙，這種情況與外科醫生的技術有很大關系。而甲減則是因為甲狀腺受損，從而產生的甲狀腺激素不足。這個時候出現甲減就屬于終身性的甲減，要終生服用，一是從低劑量開始逐步增加，一個月一次檢查一次，然后再進行一次的甲減。

甲亢突眼一般不同種類表現的并發癥不同，具體分析如下：
甲亢突眼分為單純性突眼，這是由于甲亢引起的交感神經興奮增高所致，而惡性突眼則是由于眶周組織自身免疫炎癥反應所致。單純性突眼主要表現為輕度突眼、瞬目減少、上瞼攣縮、瞼裂增寬、向下看時顯白，眼球向上看時前額皮膚不能起皺。惡性突眼主要表現為結膜充血水腫、眼瞼閉合不全、畏光流淚、眼球運動疼痛等。

甲亢并發癥有以下情況：
1、甲亢型心臟疾病，多發生在16-73歲之間，在甲亢病人中發病率為13.4%-21.8%。通常在甲狀腺功能亢進后2~3年內出現。除了有明顯的甲狀腺功能亢進的癥狀之外，心電圖上還會出現心房纖顫、心房撲動、房室傳導阻滯、室性期前收縮、心肌損傷和心肌肥大等。心臟增大主要表現為主動脈瓣型或左心擴大，一旦治療成功，心臟病就會有所改善。
2、甲亢型周期性癱瘓，常見于青年男子，與甲亢型的病癥有一定的關系。
3、甲狀腺危征，在甲狀腺功能亢進患者中，發病率在1%~2%之間，以老年人居多。臨床上常與感染、精神創傷、手術、分娩、勞累、突然停藥、藥物反應及其它并發疾病等相關。

妊娠合并甲亢，有可能會發生流產、早產、胎兒生長遲緩、妊娠期高血壓綜合征等并發癥。
對于甲亢并懷孕的女性，孕期要做好孕期的體檢，不僅要考慮到甲亢的臨床表現，還要結合內分泌科的專家進行甲狀腺的功能調節和用藥。懷孕后期要加強對孩子的監測，比如胎心監測，要結合甲功化驗的結果進行合理的用藥，如果懷孕期間甲狀腺功能正常，母親和胎兒的安全指數比較高。