小腦萎縮治療方法主要是針對不同病因進行治療，如對于遺傳性的像脊髓小腦變性、Friedreich共濟失調，這樣的病人主要是對癥處理；對于多系統萎縮小腦性的病人，也是對癥處理。對于缺血、缺氧性的，如一氧化碳中毒引起的小腦萎縮，主要是在營養神經的同時給予高氧治療。對于炎癥性的，如果急性小腦萎縮后遺癥需要抗炎治療，必要時可以給予營養神經加用免疫抑制劑等。

兒童小腦萎縮是治療不了的，只能在日常生活中多動腦子，讓患兒的大腦活躍起來。
兒童腦萎縮可能是由于大腦局部血液循環不良，神經異常等原因造成的，需要在醫生的指導下進行治療。通過對腦部的營養作用，結合針灸、理療等康復療法進行綜合治療。平時要注意飲食、營養、生活清潔，督促患者自己動手做飯，多參與工作，多與周圍的環境接觸，減緩他們的心理衰退。

小腦萎縮的治療方法具體有以下幾種：可以服用藥物，可以促進腦部血液的循環，預防血栓的形成，有利于小腦的恢復；平時可以做一些適當的體力勞動，這樣可以促進恢復；保持充足的睡眠和休息。

對于輕度萎縮的情況考慮可以就醫指導進行手術疏通治理恢復正常的，可以到當地專業正規的醫院進行檢查一下，治療期通過針對性用藥能短時間內修復病人受損腦細胞，疏通腦血管恢復腦部病灶供血供氧，激活受損“休眠”腦組織細胞，促進腦細胞新生，達到逐步恢復的效果。

小腦萎縮的康復訓練有運動功能的訓練和語言功能的訓練，一定要有平衡功能和步態姿勢的訓練，這主要是鍛煉小腦萎縮的平衡能力和走路姿勢，為了能讓活動自如一點，要進行關節活動范圍的訓練、還要增強肌力訓練等。

遺傳性小腦萎縮通常無法完全治好。如果得到積極治療，病人的病情仍能得到一定程度的控制。對于小腦萎縮，主要采用改善返祖運動的藥物進行治療，也需要對癥治療。同時也需要干預可控的致病因素。