臨床表現可涉及全身多個系統，如心血管系統、呼吸系統、消化系統、內分泌系統、代謝系統、泌尿生殖系統等，自覺癥狀繁多。如出現胸悶、憋氣、心慌、瀕死感等心臟神經癥；胃痛、胃脹、嘔吐、腹瀉等胃腸神經癥。

植物神經功能紊亂的患者會出現許多癥狀，如頭暈、出汗、潮紅、失眠、頭痛、乏力、心悸、惡心、腹部不適、焦慮、抑郁、胸悶、呼吸困難、食欲不振、性格改變、腹脹、便秘、腹瀉、腹痛、四肢麻木、關節痛、全身不適等。但經過各種詳細檢查，如果沒有發現器質性疾病，就會認為是植物神經功能紊亂。
患者需要到神經內科就診，進行焦慮抑郁量表檢查，并根據結果調整藥物治療。

有的人會出現胸悶、憋氣的感覺；有的人會有心慌，甚至是瀕死感的神經、心臟神經癥；有的人會出現胃痛、胃脹、嘔吐、腹瀉等胃腸神經癥，尤其是緊張的時候，腹痛會特別明顯；有的患者會表現為頭痛、頭暈、視物模糊、失眠、健忘、皮膚發麻、皮膚發癢或者會出現周身覺得僵硬、發緊不舒服、四肢麻木、手腳心發熱，或者是周身皮膚發熱，但是量體溫都正常，或者會有潮熱出汗，或者會有全身游走性疼痛，游走性異常感覺。

一般情況下，胃腸神經功能紊亂的癥狀可以出現各種各樣的消化道的癥狀，但是相關檢查沒有異常。具體內容如下：
植物神經紊亂患者常以自覺癥狀為主，雖然做過多次檢查，但結果往往都比較正常。如沒有食欲，進食無味，腹脹，惡心，打嗝，燒心，胸悶氣短，喜長嘆氣，喉部梗噎，咽喉不利等癥狀都屬于胃腸神經功能紊亂。建議患者在醫生的指導下使用谷維素，維生素B1，解郁抗慮膠囊等藥物進行治療。

早期植物神經功能紊亂的病人會出現很多的癥狀，比如頭暈，頭痛，乏力，出虛汗，面色潮紅，失眠，焦慮，抑郁，性格改變，人格改變，心悸，胸悶，呼吸費力，食欲減退，惡心，腹部不適，腹脹，便秘，腹瀉，腹痛，肢體麻木，關節疼痛，周身不適等。

胃腸神經功能紊亂的癥狀可以出現各種各樣的消化道的癥狀，但是相關檢查沒有異常，比如出現腹痛、腹脹、腹瀉、便秘，也可以出現反酸、燒心、惡心、嘔吐等，但是完善胃鏡、腸鏡、CT等檢查均沒有異常。