腦炎后遺癥大多數為不能說話、不能動、吞咽艱難、聽不見、記憶力減退、面無表情、眼神無光、喜怒無常、具有攻擊性、多動興奮、智力低、流汗多等神經癥狀與認知異常方面的表現。
神經功能失調：最嚴重的腦炎后遺癥的癥狀就是患兒目光呆滯而且冷漠，苦笑無常，有可能伴隨著攻擊性行為，對周圍的人做出一定的攻擊，這就是神經功能失調的表現。相應的就會在發病之后受到病毒的感染，患兒的新陳代謝也會有所影響。
保持呼吸道通暢：首先讓患兒取側臥位或頭偏向一側，松解領口及腰帶。若發作持續、意識不清、呼吸道分泌物增多，應及時吸痰，清除口腔內分泌物，防止吸入性肺炎及窒息的發生。
腦炎的后遺癥主要有：1、腦炎累及人體運動神經，引發運動功能障礙，導致四肢無力、活動能力受限的后遺癥；2、腦炎發病部位本來就屬于大腦，因此更容易損害大腦神經引發智力障礙；3、疾病累及語言神經，引發失語后遺癥；4、眼球麻痹也是腦炎的后遺癥之一，由于這種疾病也容易讓視覺神經受損；5、腦炎也容易引發肌肉萎縮的后遺癥。
一般需要做實驗室檢查，通常會出現感染癥狀如發熱、全身不適、肌痛、喉痛，可由數大到數周，而有些病例可突然發熱。發病的季節多為夏秋季，多見于小兒，嚴重的患者會出現昏迷現象。