重度腦炎一般不會有后遺癥的。大部分病毒性腦炎可以完全恢復，并不留任何神經系統后遺癥。但是少數病情嚴重，尤其是單純皰疹病毒腦炎，可有腦實質的嚴重受累，預后不良，常常遺留神經精神異常，可有運動障礙、癲癇、視聽功能受損和智力低下等。
得了重度腦炎，可能會危及病人的生命，也有少部分病人會遺留癲癇、肢體癱瘓、智能發育遲緩等后遺癥，這些后遺癥有可能會伴隨病人的一生，所以得了重度腦炎要積極的治療，盡量避免引起后遺癥。
腦炎患者通常情況下，只要痊愈，病人就沒有后遺癥，腦炎患者常常會在身體抵抗力較差、細菌、病毒、真菌等，寄生蟲等易感染中樞神經系統引起病人腦炎。
通常情況下，腦炎患者都會依據感染病原體不同而表現出相應癥狀，對大多數腦炎患者來說，都會表現出發燒、頭疼、惡心、嘔吐等癥狀，癲癇和其他病癥。這類病人一旦發生腦炎就需及時抗感染治療，由于腦炎病人，如不及時治療，病人常發生某些神經系統后遺癥，有的還可致死。
小兒腦炎主要由病毒感染引起。病毒感染的早期癥狀包括頭痛、發熱、人格變化和精神癥狀，如癲癇或發育遲滯、精神發育遲滯等，因此，不同類型的腦炎會留下不同類型的后遺癥。黑斑蚊蟲是日本腦炎的主要傳播媒介。因此，徹底消滅蚊蟲是預防腦炎最有效的方法。平時要飲食清淡，不要吃辛辣刺激性的食物。
有可能會沒有后遺癥，需要根據個人的身體素質來判斷的，每個人的恢復程度因身體原因都不太相同，平時生活中要多吃蔬菜水果，多喝水，不吃辛辣和刺激性大的食品，忌煙酒，注意按時休息，要有良好的心態和愉悅的心情。
