可以考慮手術治療。手術方法以顯微鏡下切除囊腫壁，嚴密縫合囊腫，以蛛網膜下腔的通道為主要治療策略。對無癥狀者以及MRI顯示囊腫和臨床癥狀不明顯者，一般不需要處理，可先行觀察。

骶椎椎管囊腫可以用一切不開刀的治療方法，阻止病情的發展，常用的方法有在專業醫師的指導下應用中西醫各種藥物，針灸、推拿、牽引、正骨等綜合治療。長期堅持腰背肌功能鍛煉，避免久坐彎腰，注意定期復查。

這個部位的囊腫主要會出現腰骶部疼痛，在早期囊腫比較小，也有可能是沒有癥狀，一般藥物只能是緩解，但是完全根據這個要到醫院通過手術，尤其是輸卵管的檢查，如果有輸卵管慢性炎癥或是粘連堵塞等問題，要及時進行治療，避免再次發生宮外孕。

骶管囊腫如果沒有什么特殊癥狀以觀察為主。如果骶管囊腫出現明顯的癥狀，比如下肢和會陰部的感覺疼痛、麻木、大小便失禁，則需要相應的治療措施。口服營養神經類藥物和止疼類的藥物對癥處理。如果仍然沒有明顯療效，則需要通過手術方式進行治療。

肛周膿腫的保守治療主要包括以下幾個方面抗生素抗感染治療，在臨床上一般選用對革蘭陰性桿菌有效的抗生素進行抗感染治療，做過肛周膿腫膿液的細菌培養加藥敏試驗，要根據細菌培養加藥敏試驗的結果。

肛周囊腫是可以保守治療的。肛周膿腫的保守治療方法，是在肛周膿腫早期，肛周觸及到硬結還沒有化膿，此時應該積極的抗感染治療，可以口服治療。同時每次排便后要用花椒水熏蒸坐浴，每天兩次。同時要禁食辛辣生冷，刺激油膩的食物。