免疫性腦炎的患者會出現發熱、頭痛、精神異常、認知障礙、記憶力下降、言語運動障礙、癲癇發作等癥狀。
免疫性腦炎主要表現為持續性局灶性癲癇，伴有一定的區域位置特征和對應的腦電波，并伴有相關的腦波變化。臨床上以一側的長期腦炎為主，在神經成像方面有逐漸的進展性的腦部半邊萎縮，患者需要積極進行治療，不要延誤病情。
常有發熱、頭痛等前驅癥狀。發病時主要表現為精神行為異常、認知功能障礙、近事記憶力下降、急性或亞急性癲癇發作、語言功能障礙、運動障礙、不自主運動、自主神經功能障礙以及不同程度的意識障礙甚至昏迷等。還可出現睡眠障礙，主要表現為嗜睡、睡眠覺醒周期紊亂和白天過度睡眠等。
小兒免疫性腦炎的癥狀有頭痛、發燒、惡心、食欲不振。潛伏期為4-21天，一般為10-14天。病毒首先在單核巨噬細胞中繁殖，然后釋放到血液中。大多數人在感染后沒有表現出癥狀，但是血液中的抗體會上升，這被稱為隱性感染。有些人有輕微的呼吸道癥狀。極少數病毒通過血腦屏障引起中樞神經系統損傷和腦炎癥狀。
免疫性腦炎主要癥狀有：精神障礙；癲癇發作；意識障礙；言語障礙；活動障礙；自主神經功能方面障礙；記憶力方面障礙；中樞性低通氣綜合征；部分特殊自身免疫性腦炎如LGI1腦炎臨床會有口面肌張力障礙、嗜睡、電解質紊亂等表現。
主要表現有精神癥狀、認知障礙、運動障礙和癲癇。自身免疫性腦炎，是一組因免疫系統紊亂，由體液免疫或/和細胞免疫為主介導的中樞神經系統自身免疫性疾病。平時應該控制飲食。