需要根據囊腫的大小而定，如果囊腫較大就需要進行手術切除，藥物治療是沒有什么效果，而且在術后定期復查囊腫，是有復發可能。囊腫是屬于基因突變導致的，大部分是良性的，囊腫過大是會引起腎功能的損傷，需要特別的注意。
腎臟一般出現有囊腫的情況體積較小的話，是不需要特殊的治療，如果較大的話，一般是可以通過到正規醫院手術的方法來進行治療的，在做完手術后，一定要保持樂觀的心態，在平時可以吃一些含有纖維較高的食物。
建議家長帶孩子去醫院做檢查，一般較小的單純腎囊腫生長緩慢，對腎功能的影響不大，只需要定期觀察復查即可，但是對于直徑超過4厘米的單純腎囊腫或者囊腫，需要進行手術治療。單純腎囊腫需要手術治療，第一種表現為腰腹疼痛不適或者心理壓力過大。
二是囊腫直徑大于4cm，或近期系統明顯增大。
三是囊腫壓迫，腎積水或囊腫引發出血、感染、破裂等病變。
四，有可能是癌癥患者。
腎囊腫通常海綿腎無需進行治療，多囊腎會演變為尿毒癥，無較好的治療方法。如果出現多發囊腫或普通囊腫，在排除腎癌的前提下，如果囊腫超過5cm，可以進行手術治療，比如使用腹腔鏡進行治療，不會復發，預后較好，如果囊腫小于5cm，做手術可能會導致出血，不進行手術治療。
腎囊腫是一種良性的。如果體積很小，通常沒有明顯的不適。建議病人進行腎彩色多普勒超聲檢查。如果囊腫體積較小，應該進行骨科檢查以確定是否是由腰椎間盤突出或腰肌勞損引起的。如果囊腫的體積超過4厘米，可以通過手術切除。開放手術恢復時間約為一個月。