可以通過服用利水滲濕祛濕的藥物來治療，如果腎囊腫比較小是可以起到一定的效果的。中醫認為本病多是由于腎精不足、痰瘀阻滯、脈絡不暢所致。平時飲食宜清淡，注意防寒保暖，避免過度勞累。
如果患有腎囊腫，通過西醫手術治療，大多數情況下腎囊腫不超過五公分是不需要做任何治療的。腎囊腫是屬于良性腫瘤的，不會給身體帶來過大的影響。是保持愉快的心情就可以了，不用過于擔心。
胎兒腎囊腫無需進行治療。
因為胎兒腎囊腫的發病原因，與遺傳因素或者先天發育異常有關。絕大多數的囊腫都屬于良性病變，生長速度非常緩慢。單發的腎囊腫，對于胎兒的身體健康以及出生后的身體健康，都沒有明顯的不良影響，通常是不需要進行特殊治療的。如果囊腫體積增大，可以進行手術治療或穿刺抽液治療。但如果對胎兒的身體較大時，應選擇終止妊娠。
中醫治療腎囊腫的方法有很多，患有腎囊腫要注意飲食忌口，少吃一些咸的、辛辣的食物，少吃污染的食品和燒烤類食品，多吃富含維生素或蛋白質的食物。生活中不要憋尿，經常清潔傷口。
腎囊腫較小的一般無需治療，單純性腎囊腫對周圍組織和腎功能影響不大，無需特別關注，若囊腫直徑超過10厘米，則要進行手術切除，通過腹腔鏡的方法，可對腎囊腫進行去頂，通過釋放囊液，達到治療效果。飲食上要補充高纖維，高維生素的食物，如玉米，小麥等，多吃新鮮的水果蔬菜，戒煙戒酒，不要吃辣椒，海鮮，油炸性食品。