糖皮質激素藥副作用是惡心、嘔吐、腹脹、消化道出血等胃腸道反應以及誘發感染、骨質疏松、月經紊亂、痤瘡、神經精神癥狀等。需要用糖皮質激素藥，要醫師指導下用藥物治療，避免擅自用藥。
糖皮質激素副作用主要表現有向心性的肥胖，出現滿月臉、水牛背、痤瘡、多毛、高血鈉和低血鉀、高血壓、水腫、高血糖，還有糖尿病加重、腎上腺皮質功能減退，甚至萎縮、閉經、肌肉消瘦、無力、骨質疏松、股骨頭壞死和精神癥狀等。
糖皮質激素根據半衰期的長短分為短效、中效、長效激素。短效激素包括可的松、氫化可的松。中效激素，包括強的松、強的松龍、甲基強的松龍。長效激素包括地塞米松。還有吸入的激素。包括強力布地奈德，二丙酸倍氯米松、丙酸氟地替松，具有抗炎、抗毒、抗過敏、抗休克、非特異性抑制免疫、退熱等多種的作用。
在使用激素過程中可能出現一些副作用。短期系統使用糖皮質激素可出現：情緒改變、神經過敏、高血糖、痤瘡樣皮損、胃腸道不耐受、食欲增強、失眠、月經改變、水鈉滁留、體重增加等。
糖皮質激素對人體有益又有害，具有雙面性，因為長時間服用大量的糖皮質激素會誘發或者加劇胃和十二指腸的潰瘍；誘發細菌感染；誘發高血壓、動脈粥樣硬化；誘發糖尿病、癲癇、精神病等，還會導致骨質疏松、肌肉萎縮、多毛、皮膚變薄、高血糖、低血鈣，影響兒童的生長發育，過度使用會造成喪失勞動能力。停藥后會造成腎上腺萎縮，功能障礙等。