最常見的不良反應是胃腸道的反應如厭食，惡心，嘔吐，胃部不適，反酸，燒心，還有牙齦增生伴出血疼痛，容易造成腎損害，高血壓。不常見的不良反應有驚厥，肝功能異常，膽汁淤積，高尿酸血癥，血小板減少，肢體感覺異常，高血糖過敏，白細胞減少，血尿等。
不良反應是胃腸道的反應如厭食，惡心，嘔吐，胃部不適，反酸，燒心，還有牙齦增生伴出血疼痛，容易造成腎損害，高血壓，有驚厥，肝功能異常，膽汁淤積，高尿酸血癥，血小板減少，肢體感覺異常，高血糖過敏，白細胞減少，血尿等。
最常見的不良反應是胃腸道的反應如厭食，惡心，嘔吐，胃部不適，反酸，燒心，還有牙齦增生伴出血疼痛，容易造成腎損害，高血壓，不常見的不良反應有驚厥，肝功能異常，膽汁淤積，高尿酸血癥，血小板減少，肢體感覺異常，高血糖過敏，白細胞減少，血尿等。
通常服用到環孢素懷孕第十二周后停藥。
若是孕婦因為腎臟移植后需要服用環孢素來抑制排斥反應，在懷孕以后，需要一直服用環孢素，不應該出現停藥的現象。可能是因為出現停藥的情況，可能會導致腎臟出現明顯的排斥反應，嚴重者會出現腎壞死的情況。若是孕婦在懷孕后出現胚胎停育的情況，服用環孢素進行治療，需要到懷孕十二周后在進行停藥的情況。
環孢素A是一種強效免疫抑制劑，它能夠延長同種移植皮膚、腎、肝、心臟、胰臟、骨髓、小腸和肺等器官的存活時間，并且可抑制體液免疫的活性，對細胞介導的免疫應答亦具有更強的抑制作用。
