直腸息肉一般是不能夠自愈，只能夠通過飲食或者是加強體育鍛煉的辦法控制息肉的增長速度，不能夠從根本上治療息肉。可以采取手術的方法切除息肉。對于息肉較小，并且表面光滑者可采用電灼法進行灼燒，直徑小于一厘米者還可使用套扎的辦法，從息肉的根部套上膠圈，使息肉缺血自然的脫落死亡。

直腸息肉必須切除，因為息肉的存在是有惡變風險的，而且惡病率相對比較高。可以做腸鏡在腸鏡下進行直接切除，是比較簡單的而且損傷也比較小，在良性期可以把疾病給控制。

小兒直腸息肉通常不嚴重。
孩子直腸息肉，大多由遺傳及慢性炎癥刺激所致，糞便刺激等致直腸粘膜贅生物發生癌變較少，可單發或多發。其發病機制與腸道內細菌數量及種類有關，同時與年齡大小以及飲食情況密切相關。兒童直腸息肉并不重，通常多發生在3~15歲小兒，兒童直腸息肉通常無任何臨床癥狀，嚴重者可出現腹痛、腹瀉、便血，可采用電子腸鏡檢測，亦可經電子腸鏡取出。

到三甲醫院治療腸息肉病，治療以手術治療為主。結腸息肉是黏膜表面突出到腸腔的息肉狀病變。腺瘤樣息肉是最常見的。臨床上息肉可為單個或多個，以大腸息肉多見且癥狀較明顯。可以表現出便血、腹瀉、腹痛等臨床表現。息肉切除后一般是需要以軟質的食物為主，肝臟是高膽固醇的食物，盡量吃的清淡些，可以過半個月左右在恢復到普通的食物。

通過控制飲食，可以改善病癥。飲食應該以狀態稀軟的食物為主，不要吃生硬的食物，多吃一些水果蔬菜。肉食方面需要吃一些容易消化的肉食，如魚蝦，雞肉等。盡量少吃一些油炸辛辣刺激性比較強的食物。

結直腸息肉不是不治之癥，通過及時有效的手術治療，大多數可獲得滿意的治療效果，甚至達到臨床治愈。由于息肉的發病與體質、飲食習慣、生活環境等有關，故息肉切除術后復發率較高，所以術后應定期復查腸鏡。