一般來說，胃鏡要稍微比腸鏡痛苦一點，具體分析如下：
腸鏡和胃鏡檢查在臨床上很普遍，并且隨著醫療手段的改進，這兩項檢查基本都不會非常難受，通常胃鏡要稍微比腸鏡痛苦一點。建議患者前往正規醫院進行胃鏡和腸鏡，以免導致檢查結果出現偏差。如果患者出現不適癥狀，建議患者根據實際情況前往醫院就診檢查，然后在醫生的指導下進行治療。
一般情況下，做胃鏡會比較痛苦一些，具體內容如下：
如果患者需要明確消化道的狀況，可以選擇進行胃鏡、腸鏡等檢查，從而對消化道直接進行觀察。其中，由于胃鏡是經咽喉進入患者體內的，其不適程度可能會較高。因此，做胃鏡會比較痛苦一些。如果患者需要做胃鏡，咽喉可能會受到刺激，出現惡心、嘔吐等不適癥狀。在做腸鏡時，導管通過肛門直腸進入患者體內，患者可能會有牽拉痛，但這種疼痛癥狀通常是可以忍受的。
做腸鏡還是有痛苦的，一般人是可以耐受的，但是還要因人而異。因為有些人乙狀結腸比較長，乙狀結腸是腹腔內位器官，是游離的，所以當腸鏡往前插入通過這段腸管的時候，腸管來回活動就會通過比較困難，腸鏡反復伸拉可能就會導致非常痛苦。
腸鏡檢查不舒服，但是可以堅持下來的。通過安裝于腸鏡前端的電子攝像鏡頭將結腸粘膜的圖像傳輸于計算機處理中心，然后顯示于監視器屏幕上，通過顯示屏幕可清楚觀察到大腸粘膜的細微變化如炎癥、糜爛、潰瘍、出血、色素沉著、息肉、癌癥、血管瘤、憩室、粘膜下病變等。還可以通過腸鏡的器械通道送入活檢鉗取出米粒大小的組織，病理切片進行檢查，以判斷病灶的性質，也可進行鏡下息肉治療、止血、病灶標志物定位、特殊染色處理等。
其實沒有什么痛苦。但是會有不適的感覺。檢查前1-3天吃少渣低纖維素飲食，不要吃長莖葉蔬菜。當天凌晨四點開始口服清腸液喝乳果糖100毫升，然后喝溫開水1000毫升，五點鐘再喝一瓶，然后再喝1000毫升水，一直拉到清澈清水。然后等待檢查。