長時間服用藥物也會導致神經系統和消化系統，內分泌系統發生病變，嚴重甚至會引發慢性疲勞綜合征，高血壓，心腦血管病癥等，因此服用抗焦慮藥物也不能徹底的解決問題。

長期服用藥物會對身體有一定的傷害，焦慮癥又稱為焦慮性神經癥，是神經癥這一大類疾病中最常見的一種，以焦慮情緒體驗為主要特征，嚴重者出現社會功能受損，因難以忍受又無法解脫，備感痛苦。

不能長期服用的，因為是藥都有三分毒，長期服用會感覺到一些不良反應，如心慌、頭暈、失眠、口干和震顫等。想要緩解焦慮的情緒，可以選擇心理治療或物理治療的方式來治療。

最常見的副作用是胃腸道的反應，惡心、胃口不好、便秘、腹瀉，在早期大概一兩個禮拜，藥物反應就會過去，然后慢慢身體就能適應，個體就能感受到要開始取消原來的這種癥狀。

焦慮癥病癥復雜多樣，藥物只能針對其中單一的癥狀，雖然說在短期內可以緩解人們不當的情緒，但是也有耐受性和毒副作用，極大的傷害到人們的肝腎功能，并且病毒也很容易反復，在病情惡化之后，甚至會加重人們的焦慮中，導致人們出現精神分裂。

有治療失眠的抗焦慮藥物的，例如鎮靜催眠藥。
鎮靜劑催眠劑在臨床上主要用于失眠的短期治療。可以讓失眠患者快速入睡，縮短睡眠時間，增加睡眠時間，減少覺醒次數。可以產生藥理作用，在注射少量時縮短睡眠時間，延長睡眠時間。這種藥的作用一般來說效果較快，適合各種原因引起的失眠，嚴格按照醫生的指示服用這種藥，不要超過醫生規定的使用期限。長期使用會導致依賴。