一般情況下，益生菌有潤腸通便、促進消化等作用與功效，具體內容如下：
1.潤腸通便：益生菌廣泛存在于患者的體內，有助于維系患者胃腸道的正常功能。而補充益生菌有助于促進患者胃腸道的蠕動，能起到潤腸通便的作用，有助于促進大便排出。
2.促進消化：如果患者遵醫囑使用益生菌，通常能使各類菌群在患者體內達到一個平衡狀態，從而促進患者消化，以改善腹痛、腹脹等消化不良癥狀。
治療或者預防便秘或腹瀉發生；增強人體的機體免疫力；促進營養物質吸收；防止泌尿生殖系統感染；降低膽固醇；預防骨質疏松；益生菌如果是含有乳桿菌，可以治療乳糖不耐受癥。
益生菌可以調節腸道微生態的平衡，可以調節局部和全身的免疫反應，所以益生菌能夠有增強身體免疫力的作用，可以調節微生物的失調預防腹瀉，有些寶寶對乳糖會不耐受的也可以使用益生菌去緩解的，益生菌能夠有緩解過敏癥狀的效果。在臨床上用益生菌主要是治療有腹瀉，便秘和乳糖不耐受的人群。
益生菌是腸道中的一種必需的有益細菌，主要作用是改善腹瀉、便秘，調節機體免疫力，防止過敏等。另外，益生菌在一定的程度上也起到抗腫瘤、治療疾病的作用。益生菌還可以產生各種消化酶，并且能夠緩解由于飲食不當或者有長期運用抗生素導致的菌群紊亂等。而且益生菌還對女性生殖系統的感染有一定的預防作用。
那益生菌的作用于功效是改善腸道及消化系統的功效，補充益生菌，有利于平衡腸道菌群，緩解因腸道菌群失衡所致的不良反應，而且益生菌還可促進乳糖的分解代謝，從而減少腸道負擔。增強機體免疫力的功效，益生菌可刺激免疫系統，調節免疫活性，而且還具有抗癌作用。