肝臟磁共振檢查通常是用于肝臟內的腫塊性質不明確時進行的，臨床上對于肝臟內常規檢查是做B超來檢查的，但B超檢查發現的腫塊又性質不明確的，需進行磁共振檢查并進行增強掃描，大致方法是通過磁共振檢查后注射顯影劑，觀察腫塊對顯影劑的吸收和顯影程度來判斷性質。磁共振檢查時不要戴金屬，不要活動。
所有的矮小癥都需要做核磁共振檢查，垂體是分泌生長激素的地方，如果垂體發育不良或者外傷會導致生長激素分泌減少，而矮小癥需要排除垂體的微腺瘤才能治療。
除此之外，還需進行激素分泌檢查，通常需要明確出現該病癥的病因，并對癥進行治療。平時，家長需要注意保持寶寶營養攝入均衡，可適當運動，促進身體吸收，可以改善病癥。
頭顱磁共振可以檢查腦血管病、腦炎、腦腫瘤、腦外傷、脫髓鞘疾病、神經系統變性病等。頭顱磁共振可以做血管成像，主要可用于顱內血管狹窄或閉塞、顱內動脈瘤、腦血管畸形的診斷。磁共振能顯示人體任意斷面的解剖結構，可以提供冠狀位、矢狀位和橫位三維圖像，清楚顯示腦干小腦等后顱窩病變。
可能是存在肝部囊腫的問題，可能是存在功能性減退的問題，需要就醫指導進一步檢查確定具體的情況。肝臟占位性病變即考慮腫瘤的可能，核磁檢查是為了進一步了解病變的情況。核磁相對分辨率高且對膽道系統進一步了解。還是積極配合檢查并做相關腫瘤因子檢查，必要時考慮手術治療，定期復查。
早產兒一般需要做頭顱磁共振檢查。
早產兒由于腦部發育不良，一般會在出生72小時以后進行頭顱磁共振檢查，了解其大腦的發展狀況。新生兒呼吸窘迫綜合癥等新生兒缺氧、缺氧等，要進行頭顱磁共振檢查，以確定是否有腦損害。此外，對于早產兒出現嚴重的黃疸和有缺氧缺血性腦病的患者，需要進行頭顱磁共振檢查。但是核磁共振儀的噪聲很大，要注意保護自己的耳朵。
