一般治療的時間和嚴重程度有關的，有的可能在一周到半個月左右的不等，需要定期到醫院復查，平時一定要注意個人衛生避免感染，肛瘺的主要原因是肛周膿腫，直腸肛門損傷，肛門裂反復感染等因素導致的。

如果是做手術，需要幾十分鐘的時間，肛瘺手術多長時間才能夠恢復，要因病情而異、因人而異，比如體質好的人，可能一個肛瘺十幾天就長好了，體質差的人可能得長20多天，30多天；好比說血糖高的，可能要長到兩個月才能長好。

肛瘺多久能痊愈；手術后按時換藥，平時注意衛生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食習慣，因肛瘺的發生與濕熱有關，對于油膩飲食，可以內生濕熱，所以不宜多吃。養成良好的排便習慣，每日排便后坐浴保持肛門清潔，對預防感染有積極作用。避免一直保持同樣姿勢，坐著工作的人每隔一小時要能走動三、四分鐘。

治療肛瘺要住院術后一周抗感染治療，兩天做好術前準備然后進行手術，所以都是9天左右就可以出院了。出現了之后，也是要繼續消毒，繼續坐浴治療，因為沒完全長合，掛線也還沒掉出來。

肛瘺進行手術后，是比較簡單的肛瘺，住院10天左右就可以恢復，如果是比較復雜的肛瘺可能20天左右才可以恢復，在恢復期間每天都需要消毒、清洗、換藥才可以加快恢復速度。

肛瘺多為化膿性感染所致，少數為特異性感染，如結核、克羅恩病、潰瘍性結腸炎等感染亦可所致。最佳治療辦法可以手術處理。通常術后需要半月到一月時間恢復，手術觀察期間一定要注意飲食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的衛生清洗，勤換內褲。