肛竇炎直腸炎不及時治療，可并發肛竇炎等肛腸病，并有繼發肛周膿腫的危險。廣義而言，發生在直腸的炎癥均可稱為直腸炎。常見的直腸炎主要表現為肛門下墜感、腹瀉、里急后重；血便、黏液便或黏液血便。直腸炎輕者僅黏膜發炎，重者炎癥累及黏膜下層、肌層，甚至直腸周圍組織；有時只是部分直腸受累，有時直腸全部甚或累及肛門。急性直腸炎長期不愈，則變為慢性直腸炎。

輕癥腹脹、消瘦、乏力、腸鳴、失眠、多夢、怕冷，嚴重者有可發熱，心跳加速，以及衰弱，貧血，失水，電解質平衡推敲和營養障礙。重者鮮血下流，以至休克、癌變。急性期的癥狀遷延不愈或直至放療結束6個月至數年后始有顯著癥狀者，均提示病變延續，終將發展引起纖維化或狹窄。此期內的癥狀，早的可在放療后半年，晚的可在10年后甚至30年后才發生，多與腸壁血管炎以及扣續病變有關。

肛門下墜感、腹瀉、里急后重；血便、黏液便或黏液血便。直腸炎輕者僅黏膜發炎，重者炎癥累及黏膜下層、肌層，甚至直腸周圍組織；有時只是部分直腸受累，有時直腸全部甚或累及肛門。

直腸炎會引起肚子疼、里急后重、體重減輕、低蛋白血癥、便血、結腸膨脹、左下腹痛、腸出血、糞便黑色并帶有血液、腹滿便溏、腹部不適、消瘦等癥狀，嚴重者還會胃腸道粘膜的充血、水腫、粘液分泌增多，有時伴有出血及糜爛。常伴惡心、嘔吐。

便秘與腹瀉交替，便中含有粘液及血絲，大便時肛門口灼痛。因分泌物刺激，肛門周圍表皮脫落，有時成裂口發癢，下腹部脹滿不適，食欲不振，體重減輕，全身不適。直腸出血或直腸排出粘液，由單純皰疹或巨細胞病毒引起的直腸炎，這種直腸炎的癥狀可伴有強烈的肛門直腸疼痛。

直腸炎嚴重會引起癥狀是便血，直腸出血或直腸排出黏液、黏液血便。伴有全身癥狀或消化道其他部位疾病人可出現相關癥狀，如發熱、食欲不振、惡心嘔吐、消瘦、肛門灼痛、排便下墜、里急后重等。