性炎癥的刺激：長期的慢性炎癥可能是引起肛門直腸炎的要素。如慢性細菌感染、結腸炎、憩室炎等，使得粘膜發生肉芽腫、炎性變和假息肉階段而發生炎變。良性腫瘤惡變：直腸腺瘤、乳頭狀瘤。
造成直腸炎的原因有慢性炎癥的刺激：長期的慢性炎癥可能是引起肛門直腸炎的要素。如慢性細菌感染、阿米巴痢疾、慢性非特異性結腸炎、憩室炎等，使得粘膜發生肉芽腫、炎性變和假息肉階段而發生炎變。
異物的損傷，是最常見的病因，一些不消化的異物可以引起直腸粘膜的損傷的，從而導致直腸炎。良性腫瘤惡變，也可以引起直腸炎，比如一般的直腸家族性息肉可以惡變。飲食的原因，高脂肪、高蛋白或者是低纖維素的飲食，與直腸炎的發病有明顯的關系。有毒的化學品，比如各種殺蟲劑不小心服下以后可以導致直腸粘膜的損傷，引起直腸炎。
導致的直腸炎一些慢性的細菌感染，還有感冒，都有可能遷延，導致發生直腸炎的，另外，如果有痔瘡，肛裂，毛囊炎等疾病的人，長期的刺激肛周的皮膚，也會逆行引起直腸炎的。性交不潔，有不潔性交史的人，多個性伴侶，或者是有肛交現象的人，長期的摩擦刺激，也可能會得直腸炎的。
常有發作期與緩解期交替或持續性逐漸加重，偶呈急性暴發。直腸炎癥狀反復發作的原因有，輕信偏方、盲目治療，許多人由于各種各樣原因，不去正規肛腸醫院進行治療。輕信偏方，盲目服用藥物，其結果只能是越治越重，治療淺嘗輒止，部分人雖然接受了正規治療，但是卻不能堅持下來，病情稍一緩解就擅自停止用藥，結果造成病情反復發作，以至于越來越重，還導致疾病對藥物的敏感性下降，耐藥性增強，治療難度加大。