可根據病情口服滴抗生素。中藥理氣舒腸方治療慢性期體虛無力，以排粘液為主。慢性直腸炎急性發作時，予以清熱解毒、潤腸通便。適當休息，進清淡、少渣、營養豐富、無刺激性的食物，并做到心情愉快，勞逸結合。
慢性直腸炎可予菌群微生物調節藥物治療，或者進行抗炎治療，做到三餐定時、定點和定量，不要暴飲暴食，經常吃刺激、辛辣的食物。慢性腸炎要少用一些對胃腸道刺激的藥物，以免引起胃腸道的黏膜損傷。
嚴重。直腸炎如不及時會轉為直腸癌，前期也許感覺不明顯，但免疫力會明顯下降，有婦科或男性前列腺方面的問題會隨后發生，此時伴隨結腸炎，人體50%的免疫都在結腸，所以會有很多的問題出現。
一般直腸炎伴有淺表糜爛多為潰瘍性直腸炎的癥狀，通常表現為，粘液膿血，便次增多，肛門下墜，腹痛，有時可能滴鮮血。可以使用中藥灌腸治療，配合外用藥物治療，要多吃蔬菜和水果，多喝水。
應提高警惕，注意定期復查放大染色內鏡，提早發現有癌變傾向的萎縮部位，治療上主要以對癥治療，西藥主要以助消化的藥物為主，中藥主要以對癥治療為主，益氣養陰和活血化淤的藥，也可以服用湯藥治療。