一般來說，患有卵巢囊腫要做腫瘤標志物檢查，主要是因為卵巢囊腫大部分屬于婦科良性腫瘤，但是還要排除有惡性程度的可能性，所以通常最好做腫瘤標志物的化驗檢查。此外，如果患者是卵巢囊腫，同時伴有痛經的癥狀，通過腫瘤標志物檢查，如果檢查發現CA125出現輕度升高，就高度懷疑是否由于子宮內膜異位癥引起的囊腫，通常可為臨床上下一步的治療提供可靠依據。

懷孕有卵巢囊腫可能是正常的。
卵巢囊腫是卵巢表面或內部出現的含有液態或固態物質的囊狀結構。如孕前查無卵巢囊腫，妊娠后出現卵巢囊腫屬正常現象，認為是黃體囊腫。懷孕婦女尤其早孕，卵巢可出現生理性黃體囊腫，主要保持婦女懷孕，分泌雌激素、孕激素。黃體囊腫也可以發生在輸卵管或者子宮中，而不只是局限于陰道或宮頸。通常妊娠3個月后，卵巢中胎盤組織可代替卵巢中黃體囊腫。

通常情況下，有卵巢囊腫的患者腫瘤標志物正常，說明患者患有的可能是良性的卵巢囊腫或生理性卵巢囊腫。生理性卵巢囊腫主要是由于月經周期內女性體內雌激素和孕激素水平發生周期性變化引起的；而良性卵巢囊腫的形成與遺傳因素有關，是部分卵巢組織發生了基因突變，出現了不正常的增生所形成的。并且囊內液體一般可分為黏液性和漿液性兩種，主要是由于囊壁細胞分泌了不同的物質所致。

懷孕三個月后，檢查顯示卵巢一側有一個囊腫，所以可以密切觀察和跟蹤孕期最困難的病例。在這種，懷孕期間沒有治療。分娩時選擇剖宮產，同時摘除卵巢囊腫。還需要提醒的是，懷孕期間，應注意卵巢囊腫的扭轉和破裂。一旦出現急性腹痛，就應該考慮卵巢囊腫的問題。

胎兒卵巢囊腫屬于一種病癥，其病因至今尚未確定，至今還在進行中。有人主張該種疾病是由母體和胎兒兩方面產生的促性腺激素作用所致，其治療原則是以觀測為基礎。
如果不是特別的原因，可以選擇做引產。一般都是正常的，不會對孩子今后的學習和生活造成一定的負面影響。確診之后，需要考慮胎兒的狀況，以及有沒有嚴重的內臟異常等因素，然后再考慮是不是要懷孕。

卵巢囊腫是良性腫瘤。
卵巢囊腫是常見婦科疾病的一種。卵巢囊腫在病理情況下可以分為良性惡性和交界性，所以卵巢囊腫不一定都是良性腫瘤，但是大部分卵巢囊腫是良性的，而且體積較小，不會產生壓迫癥狀。也有一部分良性卵巢囊腫體積較大，會對子宮膀胱腸道產生壓迫癥狀，如可出現腹痛腹脹，尿頻尿急尿痛等癥狀，也有可能產生卵巢囊腫蒂扭轉從而導致劇烈腹痛。