通常情況下，亞急性感染性心內膜炎是由細菌、霉菌及其它微生物所致。在進行抗生素治療的時候，要注意進行細菌培養，選用敏感的抗菌藥物。
對于亞急性感染性心內膜炎，如果使用抗生素無效，可以選擇兩種敏感的抗生素，例如氨基糖苷類和青霉素，或者連續口服頭孢曲松片進行治療，可以對草綠色鏈球菌的心內膜炎有很好的療效。

亞急性感染型心肌炎時，以草綠色鏈球菌為主，腸球菌、牛鏈球菌、表皮葡萄球菌是引起自體瓣心內膜炎的主要致病菌。有些是罕見的，例如真菌，立克次體和衣原體。腸球菌、革蘭陰性桿菌、葡萄球菌、球菌是人造心臟疾病的主要致病因子。在靜脈藥物成癮者中，以金黃色葡萄球菌最多，鏈球菌次之，革蘭陰性桿菌及霉菌最多。具體的治療方式需要遵醫囑，不要延誤治療。

亞急性感染性心肌炎中，最常見的是草綠色鏈球菌，D組溶血性鏈球菌（D-)，其中牛鏈球菌、腸球菌、表皮葡萄球菌比較常見，其它的都是罕見的。因多種傳染病或微生物累積而造成的皮膚上的外傷，通常會引起暫時的菌血癥。口腔外傷，多見于青霉素桿菌。胃腸道及泌尿路的感染及感染，通常會導致腸內球菌及格蘭氏桿菌產生菌血癥。

一般情況下，患者想要治療急性感染性心內膜炎，可以通過服用抗生素藥物來進行治療，但是不要濫用抗生素等藥物，建議患者遵醫囑進行使用。
另外，患者在日常生活中，還要保持口腔、牙齒和皮膚的衛生，防止皮膚黏膜損傷后的繼發性感染。在日常飲食方面，注意均衡營養，保證蛋白質、維生素等營養素的攝入。
治療期間還應該注意多喝溫水、多休息，盡量少吃或不吃油膩、辛辣的食物。

一般情況下，小兒感染性心內膜炎是否需要手術需要根據病情做判斷。具體分析如下：
通常來講，一般出現患兒并發嚴重心力衰竭、或經抗生素治療后，仍持續發熱以及經內科保守治療后，血培養仍呈陽性，心臟內贅生物增大，不見好轉等情況。一般根據醫生判斷選擇合適治療方式即可，除手術外，還可選用合適的抗生素，并足量全程的應用，也可達到很好的治療效果。

一般來說，急性感染性心內膜炎吃以下食物比較好。具體分析如下：
急性感染性心內膜炎致病微生物毒性強，多為全身嚴重感染的一部分。吃雞蛋、魚類、豆制品等易消化、吸收的蛋白質食物，比較好。此外，木耳、銀耳、香菇、蘑菇等可增加免疫功能的食物也對身體有好處。
日常生活中，患者應當嚴格依照醫生的叮囑用藥治療，不可自行停止用藥，否則會對疾病的好轉造成不良影響。