陰莖短小的治療方法包括生理性陰莖短小，多見于恥骨聯合部、會陰部脂肪較多的男性，可通過手術治療，去除多余的脂肪，使陰莖得以延長至正常長度，病理性陰莖短小，染色體異常、克氏綜合征、卡爾曼綜合征導致的陰莖短小，應及時就診，明確病因，對癥治療。

肥胖導致陰莖短的小該需要合理減肥，還可以通過手術進行治療。1、既然是因為肥胖癥，那就一定要瘦，最重要的是，體重減輕了，陰莖附近的肥肉就會消退，露出的陰莖就會變大。2、如果出現了很嚴重的問題，或者多次的減肥不成功，需要做的是在做手術的時候，因為切除了大量的包皮，也會讓陰莖變得比之前長。建議家長根據小孩的具體情況，選擇合適的方式來處理。

一般情況下，男性的陰莖短小，可以在醫生的指導下通過藥物治療、手術治療等方式進行治療。具體情況分析如下：
陰莖短是一種常見的診斷標準，成年男性的陰莖長度小于4cm，勃起時長度小于8cm。遺傳因素、肥胖、雄性激素分泌下降、營養不良等都是導致陰莖短小的主要原因。比如加強營養、外源性雄激素（口服十一酸睪丸酮等）、減肥等。陰莖整形延長手術是由于生殖器畸形引起的陰莖短小。

如果出現了陰莖短小，往往和先天性的發育有直接的關系。可以考慮及時的到醫院進行陰莖延長手術，陰莖的長度可以明顯的改善。如果患者陰莖的長度大于10厘米是屬于完全正常的。

陰莖細而短小考慮是發育的問題，成年男子成熟期是18周歲基本發育就差不多了，陰莖不能二次發育，如果疲軟狀態下小于5厘米，而且勃起時小于10厘米，屬于陰莖短小，年齡不大，可以再觀察兩年，如果沒有實質性的改善，再考慮手術治療。

主要考慮是發育異常，或者是龜頭過于敏感導致的，可以通過飲食來進行調節，以后建議可以多吃點羊肉，牛肉，狗肉，以及這些動物的睪丸，韭菜，枸杞來進行調理，也可以加強對陰莖方面的鍛煉，比如可以反復的刺激，揉搓，按摩陰莖，對于陰莖的增長有一定幫助。平時建議要加強鍛煉身體，多做有氧運動，比如爬山跑步打球之類的運動，增強機體耐力，也有助于改善早泄的癥狀。